Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GJA9P57773 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GJA9P57773 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GJA9P57773 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
GJA9P57773 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
GJA9P57773 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GJA9P57773 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
GJA9P57773 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GJA9P57773 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GJA9P57773 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GJA9P57773 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GJA9P57773 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GJA9P57773 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GJA9P57773 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GJA9P57773 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GJA9P57773 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GJA9P57773 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GJA9P57773 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GJA9P57773 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GJA9P57773 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GJA9P57773 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
GJA9P57773 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GJA9P57773 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GJA9P57773 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GJA9P57773 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GJA9P57773 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GJA9P57773 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GJA9P57773 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GJA9P57773 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GJA9P57773 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GJA9P57773 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GJA9P57773 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GJA9P57773 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GJA9P57773 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GJA9P57773 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
GJA9P57773 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GJA9P57773 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GJA9P57773 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GJA9P57773 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GJA9P57773 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GJA9P57773 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
GJA9P57773 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GJA9P57773 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GJA9P57773 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GJA9P57773 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
GJA9P57773 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GJA9P57773 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GJA9P57773 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GJA9P57773 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GJA9P57773 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
GJA9P57773 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GJA9P57773 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GJA9P57773 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GJA9P57773 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GJA9P57773 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GJA9P57773 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GJA9P57773 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GJA9P57773 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GJA9P57773 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GJA9P57773 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GJA9P57773 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GJA9P57773 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GJA9P57773 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GJA9P57773 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
GJA9P57773 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GJA9P57773 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GJA9P57773 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GJA9P57773 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GJA9P57773 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GJA9P57773 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GJA9P57773 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
GJA9P57773 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GJA9P57773 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GJA9P57773 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
GJA9P57773 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GJA9P57773 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
GJA9P57773 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GJA9P57773 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GJA9P57773 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GJA9P57773 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GJA9P57773 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GJA9P57773 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GJA9P57773 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
GJA9P57773 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GJA9P57773 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GJA9P57773 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GJA9P57773 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GJA9P57773 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GJA9P57773 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GJA9P57773 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GJA9P57773 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GJA9P57773 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJA9P57773 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJA9P57773 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJA9P57773 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJA9P57773 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJA9P57773 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJA9P57773 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJA9P57773 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJA9P57773 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms