Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB25P57735 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB25P57735 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB25P57735 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB25P57735 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB25P57735 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB25P57735 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB25P57735 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
RAB25P57735 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB25P57735 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB25P57735 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB25P57735 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB25P57735 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB25P57735 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB25P57735 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB25P57735 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB25P57735 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB25P57735 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB25P57735 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB25P57735 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB25P57735 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB25P57735 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB25P57735 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB25P57735 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB25P57735 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB25P57735 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB25P57735 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB25P57735 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB25P57735 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB25P57735 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB25P57735 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB25P57735 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB25P57735 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB25P57735 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB25P57735 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB25P57735 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB25P57735 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB25P57735 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB25P57735 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB25P57735 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB25P57735 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB25P57735 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB25P57735 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB25P57735 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB25P57735 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB25P57735 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB25P57735 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB25P57735 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB25P57735 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB25P57735 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB25P57735 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB25P57735 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAB25P57735 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAB25P57735 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAB25P57735 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAB25P57735 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAB25P57735 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
RAB25P57735 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB25P57735 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB25P57735 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB25P57735 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB25P57735 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB25P57735 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB25P57735 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB25P57735 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB25P57735 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB25P57735 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB25P57735 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB25P57735 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB25P57735 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB25P57735 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB25P57735 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB25P57735 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB25P57735 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB25P57735 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB25P57735 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB25P57735 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB25P57735 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB25P57735 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB25P57735 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB25P57735 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB25P57735 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB25P57735 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB25P57735 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB25P57735 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB25P57735 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB25P57735 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB25P57735 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB25P57735 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB25P57735 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB25P57735 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB25P57735 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB25P57735 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB25P57735 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB25P57735 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB25P57735 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB25P57735 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB25P57735 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB25P57735 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB25P57735 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms