Protein–RNA interactions for Protein: P57082

TBX4, T-box transcription factor TBX4, humanhuman

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX4P57082 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TBX4P57082 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TBX4P57082 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TBX4P57082 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TBX4P57082 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TBX4P57082 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TBX4P57082 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TBX4P57082 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TBX4P57082 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TBX4P57082 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TBX4P57082 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TBX4P57082 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TBX4P57082 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TBX4P57082 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TBX4P57082 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TBX4P57082 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TBX4P57082 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TBX4P57082 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TBX4P57082 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TBX4P57082 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TBX4P57082 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TBX4P57082 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TBX4P57082 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TBX4P57082 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TBX4P57082 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TBX4P57082 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TBX4P57082 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TBX4P57082 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TBX4P57082 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TBX4P57082 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TBX4P57082 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TBX4P57082 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TBX4P57082 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TBX4P57082 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TBX4P57082 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TBX4P57082 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TBX4P57082 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TBX4P57082 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TBX4P57082 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TBX4P57082 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TBX4P57082 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TBX4P57082 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TBX4P57082 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TBX4P57082 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TBX4P57082 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TBX4P57082 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TBX4P57082 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TBX4P57082 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TBX4P57082 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TBX4P57082 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TBX4P57082 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TBX4P57082 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TBX4P57082 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TBX4P57082 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TBX4P57082 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TBX4P57082 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TBX4P57082 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TBX4P57082 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TBX4P57082 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TBX4P57082 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TBX4P57082 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TBX4P57082 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TBX4P57082 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TBX4P57082 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TBX4P57082 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TBX4P57082 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TBX4P57082 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TBX4P57082 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TBX4P57082 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TBX4P57082 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TBX4P57082 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TBX4P57082 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TBX4P57082 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TBX4P57082 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TBX4P57082 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TBX4P57082 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TBX4P57082 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TBX4P57082 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TBX4P57082 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TBX4P57082 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TBX4P57082 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TBX4P57082 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TBX4P57082 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TBX4P57082 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TBX4P57082 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TBX4P57082 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TBX4P57082 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TBX4P57082 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TBX4P57082 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TBX4P57082 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TBX4P57082 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TBX4P57082 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TBX4P57082 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TBX4P57082 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TBX4P57082 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TBX4P57082 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TBX4P57082 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TBX4P57082 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TBX4P57082 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TBX4P57082 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms