Protein–RNA interactions for Protein: P56747

CLDN6, Claudin-6, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN6P56747 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN6P56747 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN6P56747 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN6P56747 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN6P56747 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN6P56747 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN6P56747 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN6P56747 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN6P56747 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN6P56747 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLDN6P56747 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN6P56747 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN6P56747 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN6P56747 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN6P56747 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN6P56747 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN6P56747 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN6P56747 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN6P56747 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN6P56747 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN6P56747 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN6P56747 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN6P56747 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN6P56747 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN6P56747 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN6P56747 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN6P56747 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN6P56747 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN6P56747 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN6P56747 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN6P56747 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN6P56747 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN6P56747 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN6P56747 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN6P56747 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN6P56747 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN6P56747 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN6P56747 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN6P56747 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN6P56747 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN6P56747 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN6P56747 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN6P56747 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN6P56747 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN6P56747 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN6P56747 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN6P56747 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN6P56747 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN6P56747 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN6P56747 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN6P56747 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN6P56747 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CLDN6P56747 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN6P56747 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN6P56747 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN6P56747 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN6P56747 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN6P56747 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN6P56747 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN6P56747 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN6P56747 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN6P56747 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN6P56747 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN6P56747 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN6P56747 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN6P56747 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN6P56747 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN6P56747 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN6P56747 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN6P56747 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN6P56747 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN6P56747 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN6P56747 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN6P56747 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN6P56747 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN6P56747 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN6P56747 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN6P56747 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN6P56747 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN6P56747 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN6P56747 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN6P56747 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN6P56747 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN6P56747 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN6P56747 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN6P56747 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN6P56747 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN6P56747 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN6P56747 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN6P56747 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN6P56747 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN6P56747 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN6P56747 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN6P56747 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN6P56747 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN6P56747 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN6P56747 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN6P56747 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN6P56747 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN6P56747 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms