Protein–RNA interactions for Protein: P56715

RP1, Oxygen-regulated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RP1P56715 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RP1P56715 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RP1P56715 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RP1P56715 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RP1P56715 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RP1P56715 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RP1P56715 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RP1P56715 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RP1P56715 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RP1P56715 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RP1P56715 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RP1P56715 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RP1P56715 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RP1P56715 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RP1P56715 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RP1P56715 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RP1P56715 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RP1P56715 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RP1P56715 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RP1P56715 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RP1P56715 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RP1P56715 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RP1P56715 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RP1P56715 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RP1P56715 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RP1P56715 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RP1P56715 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RP1P56715 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RP1P56715 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RP1P56715 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RP1P56715 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RP1P56715 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RP1P56715 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RP1P56715 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RP1P56715 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RP1P56715 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RP1P56715 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RP1P56715 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RP1P56715 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RP1P56715 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RP1P56715 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RP1P56715 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RP1P56715 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RP1P56715 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RP1P56715 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RP1P56715 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RP1P56715 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RP1P56715 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RP1P56715 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RP1P56715 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RP1P56715 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RP1P56715 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RP1P56715 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RP1P56715 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RP1P56715 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RP1P56715 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RP1P56715 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RP1P56715 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RP1P56715 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RP1P56715 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RP1P56715 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RP1P56715 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RP1P56715 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RP1P56715 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RP1P56715 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RP1P56715 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RP1P56715 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RP1P56715 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RP1P56715 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RP1P56715 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RP1P56715 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RP1P56715 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RP1P56715 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RP1P56715 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RP1P56715 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RP1P56715 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RP1P56715 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RP1P56715 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RP1P56715 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RP1P56715 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RP1P56715 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RP1P56715 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RP1P56715 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RP1P56715 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RP1P56715 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RP1P56715 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RP1P56715 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RP1P56715 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RP1P56715 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RP1P56715 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RP1P56715 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RP1P56715 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RP1P56715 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RP1P56715 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RP1P56715 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RP1P56715 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RP1P56715 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RP1P56715 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RP1P56715 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RP1P56715 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms