Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPTEP56180 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPTEP56180 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPTEP56180 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPTEP56180 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPTEP56180 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPTEP56180 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPTEP56180 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPTEP56180 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPTEP56180 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPTEP56180 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPTEP56180 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPTEP56180 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPTEP56180 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPTEP56180 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPTEP56180 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPTEP56180 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPTEP56180 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPTEP56180 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPTEP56180 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPTEP56180 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPTEP56180 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPTEP56180 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPTEP56180 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPTEP56180 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPTEP56180 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPTEP56180 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPTEP56180 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPTEP56180 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPTEP56180 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPTEP56180 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPTEP56180 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPTEP56180 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPTEP56180 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPTEP56180 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPTEP56180 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPTEP56180 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPTEP56180 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPTEP56180 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPTEP56180 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPTEP56180 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPTEP56180 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPTEP56180 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
TPTEP56180 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPTEP56180 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPTEP56180 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPTEP56180 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPTEP56180 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPTEP56180 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TPTEP56180 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TPTEP56180 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TPTEP56180 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TPTEP56180 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TPTEP56180 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TPTEP56180 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TPTEP56180 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TPTEP56180 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPTEP56180 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPTEP56180 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPTEP56180 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPTEP56180 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPTEP56180 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPTEP56180 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPTEP56180 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPTEP56180 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPTEP56180 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPTEP56180 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPTEP56180 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPTEP56180 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPTEP56180 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPTEP56180 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPTEP56180 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPTEP56180 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPTEP56180 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TPTEP56180 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPTEP56180 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPTEP56180 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPTEP56180 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPTEP56180 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPTEP56180 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPTEP56180 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TPTEP56180 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TPTEP56180 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TPTEP56180 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TPTEP56180 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TPTEP56180 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TPTEP56180 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TPTEP56180 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TPTEP56180 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TPTEP56180 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TPTEP56180 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TPTEP56180 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TPTEP56180 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TPTEP56180 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TPTEP56180 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TPTEP56180 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TPTEP56180 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TPTEP56180 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TPTEP56180 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TPTEP56180 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms