Protein–RNA interactions for Protein: P55899

FCGRT, IgG receptor FcRn large subunit p51, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCGRTP55899 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
FCGRTP55899 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
FCGRTP55899 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FCGRTP55899 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FCGRTP55899 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
FCGRTP55899 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
FCGRTP55899 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FCGRTP55899 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FCGRTP55899 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FCGRTP55899 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FCGRTP55899 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FCGRTP55899 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FCGRTP55899 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
FCGRTP55899 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
FCGRTP55899 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
FCGRTP55899 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FCGRTP55899 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FCGRTP55899 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FCGRTP55899 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FCGRTP55899 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FCGRTP55899 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FCGRTP55899 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FCGRTP55899 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FCGRTP55899 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FCGRTP55899 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FCGRTP55899 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FCGRTP55899 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FCGRTP55899 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FCGRTP55899 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FCGRTP55899 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FCGRTP55899 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FCGRTP55899 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FCGRTP55899 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FCGRTP55899 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
FCGRTP55899 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FCGRTP55899 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FCGRTP55899 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FCGRTP55899 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FCGRTP55899 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FCGRTP55899 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FCGRTP55899 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FCGRTP55899 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FCGRTP55899 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FCGRTP55899 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FCGRTP55899 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FCGRTP55899 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FCGRTP55899 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FCGRTP55899 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FCGRTP55899 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
FCGRTP55899 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FCGRTP55899 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FCGRTP55899 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
FCGRTP55899 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FCGRTP55899 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FCGRTP55899 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FCGRTP55899 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FCGRTP55899 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FCGRTP55899 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FCGRTP55899 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FCGRTP55899 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
FCGRTP55899 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FCGRTP55899 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FCGRTP55899 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FCGRTP55899 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FCGRTP55899 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FCGRTP55899 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FCGRTP55899 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
FCGRTP55899 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FCGRTP55899 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FCGRTP55899 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
FCGRTP55899 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
FCGRTP55899 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FCGRTP55899 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FCGRTP55899 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FCGRTP55899 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
FCGRTP55899 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FCGRTP55899 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
FCGRTP55899 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FCGRTP55899 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FCGRTP55899 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FCGRTP55899 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FCGRTP55899 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FCGRTP55899 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FCGRTP55899 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
FCGRTP55899 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FCGRTP55899 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FCGRTP55899 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FCGRTP55899 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FCGRTP55899 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FCGRTP55899 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FCGRTP55899 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FCGRTP55899 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FCGRTP55899 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FCGRTP55899 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FCGRTP55899 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FCGRTP55899 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
FCGRTP55899 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FCGRTP55899 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FCGRTP55899 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FCGRTP55899 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms