Protein–RNA interactions for Protein: P55286

CDH8, Cadherin-8, humanhuman

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH8P55286 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CDH8P55286 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDH8P55286 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CDH8P55286 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDH8P55286 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDH8P55286 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDH8P55286 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDH8P55286 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDH8P55286 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDH8P55286 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDH8P55286 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDH8P55286 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDH8P55286 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDH8P55286 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDH8P55286 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDH8P55286 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDH8P55286 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDH8P55286 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDH8P55286 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDH8P55286 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDH8P55286 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDH8P55286 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDH8P55286 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CDH8P55286 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDH8P55286 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDH8P55286 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDH8P55286 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDH8P55286 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDH8P55286 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDH8P55286 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CDH8P55286 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDH8P55286 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDH8P55286 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDH8P55286 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDH8P55286 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDH8P55286 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDH8P55286 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDH8P55286 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDH8P55286 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDH8P55286 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDH8P55286 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDH8P55286 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDH8P55286 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDH8P55286 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDH8P55286 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDH8P55286 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDH8P55286 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDH8P55286 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDH8P55286 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDH8P55286 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDH8P55286 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CDH8P55286 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CDH8P55286 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDH8P55286 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDH8P55286 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDH8P55286 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDH8P55286 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDH8P55286 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDH8P55286 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDH8P55286 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDH8P55286 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDH8P55286 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDH8P55286 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDH8P55286 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDH8P55286 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CDH8P55286 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDH8P55286 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDH8P55286 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDH8P55286 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDH8P55286 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDH8P55286 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDH8P55286 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDH8P55286 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDH8P55286 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDH8P55286 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDH8P55286 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDH8P55286 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDH8P55286 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDH8P55286 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDH8P55286 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDH8P55286 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDH8P55286 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDH8P55286 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDH8P55286 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDH8P55286 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDH8P55286 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDH8P55286 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CDH8P55286 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDH8P55286 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDH8P55286 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDH8P55286 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDH8P55286 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDH8P55286 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDH8P55286 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDH8P55286 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDH8P55286 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDH8P55286 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDH8P55286 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDH8P55286 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDH8P55286 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms