Protein–RNA interactions for Protein: P55107

GDF10, Growth/differentiation factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF10P55107 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GDF10P55107 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GDF10P55107 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GDF10P55107 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GDF10P55107 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GDF10P55107 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GDF10P55107 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GDF10P55107 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GDF10P55107 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GDF10P55107 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GDF10P55107 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GDF10P55107 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GDF10P55107 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GDF10P55107 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GDF10P55107 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GDF10P55107 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GDF10P55107 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GDF10P55107 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GDF10P55107 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GDF10P55107 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GDF10P55107 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GDF10P55107 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GDF10P55107 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
GDF10P55107 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GDF10P55107 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GDF10P55107 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GDF10P55107 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GDF10P55107 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GDF10P55107 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GDF10P55107 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GDF10P55107 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GDF10P55107 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GDF10P55107 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GDF10P55107 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GDF10P55107 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GDF10P55107 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GDF10P55107 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GDF10P55107 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GDF10P55107 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GDF10P55107 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GDF10P55107 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GDF10P55107 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GDF10P55107 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GDF10P55107 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GDF10P55107 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GDF10P55107 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GDF10P55107 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GDF10P55107 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GDF10P55107 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GDF10P55107 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GDF10P55107 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GDF10P55107 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GDF10P55107 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GDF10P55107 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GDF10P55107 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GDF10P55107 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GDF10P55107 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GDF10P55107 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GDF10P55107 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GDF10P55107 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GDF10P55107 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GDF10P55107 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GDF10P55107 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GDF10P55107 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GDF10P55107 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GDF10P55107 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GDF10P55107 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GDF10P55107 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GDF10P55107 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GDF10P55107 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
GDF10P55107 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GDF10P55107 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GDF10P55107 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GDF10P55107 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GDF10P55107 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GDF10P55107 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GDF10P55107 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GDF10P55107 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GDF10P55107 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GDF10P55107 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GDF10P55107 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GDF10P55107 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GDF10P55107 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GDF10P55107 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GDF10P55107 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GDF10P55107 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GDF10P55107 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GDF10P55107 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GDF10P55107 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GDF10P55107 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GDF10P55107 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GDF10P55107 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GDF10P55107 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GDF10P55107 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GDF10P55107 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GDF10P55107 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GDF10P55107 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GDF10P55107 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GDF10P55107 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GDF10P55107 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms