Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HADHBP55084 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HADHBP55084 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HADHBP55084 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HADHBP55084 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HADHBP55084 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HADHBP55084 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HADHBP55084 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HADHBP55084 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HADHBP55084 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HADHBP55084 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HADHBP55084 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HADHBP55084 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HADHBP55084 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HADHBP55084 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HADHBP55084 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HADHBP55084 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HADHBP55084 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HADHBP55084 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HADHBP55084 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HADHBP55084 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HADHBP55084 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
HADHBP55084 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HADHBP55084 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HADHBP55084 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HADHBP55084 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HADHBP55084 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HADHBP55084 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HADHBP55084 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HADHBP55084 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HADHBP55084 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HADHBP55084 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HADHBP55084 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HADHBP55084 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
HADHBP55084 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HADHBP55084 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HADHBP55084 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HADHBP55084 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HADHBP55084 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HADHBP55084 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HADHBP55084 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HADHBP55084 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HADHBP55084 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HADHBP55084 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HADHBP55084 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
HADHBP55084 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HADHBP55084 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HADHBP55084 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HADHBP55084 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HADHBP55084 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HADHBP55084 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HADHBP55084 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HADHBP55084 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HADHBP55084 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HADHBP55084 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HADHBP55084 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HADHBP55084 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HADHBP55084 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HADHBP55084 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HADHBP55084 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HADHBP55084 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HADHBP55084 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HADHBP55084 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HADHBP55084 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HADHBP55084 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HADHBP55084 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HADHBP55084 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HADHBP55084 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HADHBP55084 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HADHBP55084 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HADHBP55084 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HADHBP55084 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HADHBP55084 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HADHBP55084 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HADHBP55084 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HADHBP55084 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HADHBP55084 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HADHBP55084 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HADHBP55084 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HADHBP55084 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HADHBP55084 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HADHBP55084 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HADHBP55084 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HADHBP55084 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HADHBP55084 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HADHBP55084 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HADHBP55084 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HADHBP55084 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HADHBP55084 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HADHBP55084 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HADHBP55084 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HADHBP55084 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HADHBP55084 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HADHBP55084 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HADHBP55084 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HADHBP55084 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
HADHBP55084 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HADHBP55084 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
HADHBP55084 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HADHBP55084 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms