Protein–RNA interactions for Protein: P54687

BCAT1, Branched-chain-amino-acid aminotransferase, cytosolic, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAT1P54687 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BCAT1P54687 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
BCAT1P54687 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BCAT1P54687 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BCAT1P54687 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BCAT1P54687 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BCAT1P54687 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BCAT1P54687 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCAT1P54687 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCAT1P54687 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCAT1P54687 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCAT1P54687 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
BCAT1P54687 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCAT1P54687 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BCAT1P54687 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BCAT1P54687 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BCAT1P54687 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BCAT1P54687 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BCAT1P54687 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BCAT1P54687 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BCAT1P54687 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCAT1P54687 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCAT1P54687 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCAT1P54687 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCAT1P54687 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCAT1P54687 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCAT1P54687 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
BCAT1P54687 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCAT1P54687 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCAT1P54687 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCAT1P54687 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCAT1P54687 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCAT1P54687 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCAT1P54687 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCAT1P54687 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCAT1P54687 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCAT1P54687 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCAT1P54687 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
BCAT1P54687 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCAT1P54687 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCAT1P54687 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCAT1P54687 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCAT1P54687 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BCAT1P54687 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BCAT1P54687 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
BCAT1P54687 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BCAT1P54687 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BCAT1P54687 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BCAT1P54687 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BCAT1P54687 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BCAT1P54687 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BCAT1P54687 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BCAT1P54687 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BCAT1P54687 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BCAT1P54687 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BCAT1P54687 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BCAT1P54687 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
BCAT1P54687 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BCAT1P54687 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BCAT1P54687 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BCAT1P54687 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BCAT1P54687 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BCAT1P54687 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BCAT1P54687 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BCAT1P54687 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BCAT1P54687 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BCAT1P54687 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BCAT1P54687 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BCAT1P54687 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BCAT1P54687 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BCAT1P54687 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BCAT1P54687 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BCAT1P54687 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BCAT1P54687 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BCAT1P54687 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BCAT1P54687 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BCAT1P54687 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BCAT1P54687 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BCAT1P54687 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BCAT1P54687 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BCAT1P54687 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BCAT1P54687 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BCAT1P54687 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BCAT1P54687 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
BCAT1P54687 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BCAT1P54687 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BCAT1P54687 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BCAT1P54687 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BCAT1P54687 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BCAT1P54687 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BCAT1P54687 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
BCAT1P54687 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BCAT1P54687 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BCAT1P54687 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BCAT1P54687 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BCAT1P54687 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BCAT1P54687 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BCAT1P54687 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BCAT1P54687 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BCAT1P54687 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms