Protein–RNA interactions for Protein: P53667

LIMK1, LIM domain kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK1P53667 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LIMK1P53667 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LIMK1P53667 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIMK1P53667 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LIMK1P53667 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LIMK1P53667 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LIMK1P53667 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LIMK1P53667 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LIMK1P53667 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LIMK1P53667 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LIMK1P53667 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LIMK1P53667 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LIMK1P53667 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LIMK1P53667 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIMK1P53667 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIMK1P53667 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIMK1P53667 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIMK1P53667 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIMK1P53667 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIMK1P53667 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIMK1P53667 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIMK1P53667 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIMK1P53667 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIMK1P53667 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIMK1P53667 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIMK1P53667 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIMK1P53667 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIMK1P53667 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIMK1P53667 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LIMK1P53667 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIMK1P53667 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIMK1P53667 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIMK1P53667 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIMK1P53667 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIMK1P53667 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIMK1P53667 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIMK1P53667 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LIMK1P53667 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIMK1P53667 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIMK1P53667 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIMK1P53667 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIMK1P53667 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIMK1P53667 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LIMK1P53667 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LIMK1P53667 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LIMK1P53667 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LIMK1P53667 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LIMK1P53667 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LIMK1P53667 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LIMK1P53667 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LIMK1P53667 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LIMK1P53667 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LIMK1P53667 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LIMK1P53667 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LIMK1P53667 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LIMK1P53667 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LIMK1P53667 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LIMK1P53667 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LIMK1P53667 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LIMK1P53667 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LIMK1P53667 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LIMK1P53667 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LIMK1P53667 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LIMK1P53667 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LIMK1P53667 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LIMK1P53667 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LIMK1P53667 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LIMK1P53667 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LIMK1P53667 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LIMK1P53667 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LIMK1P53667 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LIMK1P53667 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LIMK1P53667 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LIMK1P53667 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LIMK1P53667 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LIMK1P53667 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LIMK1P53667 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LIMK1P53667 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LIMK1P53667 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LIMK1P53667 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LIMK1P53667 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LIMK1P53667 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LIMK1P53667 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LIMK1P53667 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LIMK1P53667 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LIMK1P53667 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LIMK1P53667 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LIMK1P53667 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LIMK1P53667 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LIMK1P53667 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LIMK1P53667 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LIMK1P53667 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LIMK1P53667 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LIMK1P53667 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LIMK1P53667 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LIMK1P53667 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LIMK1P53667 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LIMK1P53667 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LIMK1P53667 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LIMK1P53667 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms