Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COPAP53621 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COPAP53621 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COPAP53621 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COPAP53621 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COPAP53621 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COPAP53621 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COPAP53621 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COPAP53621 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COPAP53621 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COPAP53621 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COPAP53621 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COPAP53621 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COPAP53621 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COPAP53621 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COPAP53621 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
COPAP53621 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
COPAP53621 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COPAP53621 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COPAP53621 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COPAP53621 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COPAP53621 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COPAP53621 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COPAP53621 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COPAP53621 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COPAP53621 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COPAP53621 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COPAP53621 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COPAP53621 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
COPAP53621 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
COPAP53621 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
COPAP53621 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COPAP53621 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COPAP53621 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COPAP53621 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COPAP53621 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COPAP53621 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COPAP53621 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COPAP53621 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COPAP53621 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
COPAP53621 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COPAP53621 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
COPAP53621 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COPAP53621 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
COPAP53621 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COPAP53621 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COPAP53621 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
COPAP53621 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COPAP53621 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COPAP53621 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COPAP53621 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COPAP53621 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
COPAP53621 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COPAP53621 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COPAP53621 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COPAP53621 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COPAP53621 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COPAP53621 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COPAP53621 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COPAP53621 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COPAP53621 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COPAP53621 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COPAP53621 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COPAP53621 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COPAP53621 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COPAP53621 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COPAP53621 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COPAP53621 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COPAP53621 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COPAP53621 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COPAP53621 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COPAP53621 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COPAP53621 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COPAP53621 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COPAP53621 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COPAP53621 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COPAP53621 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
COPAP53621 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
COPAP53621 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
COPAP53621 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COPAP53621 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COPAP53621 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COPAP53621 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COPAP53621 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
COPAP53621 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
COPAP53621 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
COPAP53621 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COPAP53621 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COPAP53621 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COPAP53621 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COPAP53621 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COPAP53621 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COPAP53621 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
COPAP53621 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COPAP53621 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COPAP53621 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COPAP53621 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COPAP53621 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COPAP53621 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COPAP53621 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms