Protein–RNA interactions for Protein: P53611

RABGGTB, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTBP53611 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RABGGTBP53611 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RABGGTBP53611 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RABGGTBP53611 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RABGGTBP53611 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RABGGTBP53611 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RABGGTBP53611 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RABGGTBP53611 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RABGGTBP53611 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RABGGTBP53611 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RABGGTBP53611 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RABGGTBP53611 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RABGGTBP53611 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RABGGTBP53611 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RABGGTBP53611 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RABGGTBP53611 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RABGGTBP53611 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RABGGTBP53611 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RABGGTBP53611 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RABGGTBP53611 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RABGGTBP53611 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RABGGTBP53611 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RABGGTBP53611 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RABGGTBP53611 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RABGGTBP53611 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RABGGTBP53611 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RABGGTBP53611 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RABGGTBP53611 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RABGGTBP53611 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RABGGTBP53611 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RABGGTBP53611 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RABGGTBP53611 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RABGGTBP53611 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RABGGTBP53611 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RABGGTBP53611 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RABGGTBP53611 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RABGGTBP53611 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RABGGTBP53611 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RABGGTBP53611 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RABGGTBP53611 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RABGGTBP53611 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RABGGTBP53611 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RABGGTBP53611 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RABGGTBP53611 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RABGGTBP53611 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RABGGTBP53611 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RABGGTBP53611 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RABGGTBP53611 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RABGGTBP53611 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RABGGTBP53611 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RABGGTBP53611 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RABGGTBP53611 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RABGGTBP53611 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RABGGTBP53611 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RABGGTBP53611 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RABGGTBP53611 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RABGGTBP53611 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RABGGTBP53611 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RABGGTBP53611 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RABGGTBP53611 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RABGGTBP53611 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RABGGTBP53611 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RABGGTBP53611 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
RABGGTBP53611 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
RABGGTBP53611 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
RABGGTBP53611 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RABGGTBP53611 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RABGGTBP53611 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
RABGGTBP53611 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RABGGTBP53611 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RABGGTBP53611 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RABGGTBP53611 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RABGGTBP53611 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RABGGTBP53611 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RABGGTBP53611 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RABGGTBP53611 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RABGGTBP53611 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RABGGTBP53611 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RABGGTBP53611 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RABGGTBP53611 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RABGGTBP53611 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RABGGTBP53611 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RABGGTBP53611 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RABGGTBP53611 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RABGGTBP53611 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RABGGTBP53611 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RABGGTBP53611 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RABGGTBP53611 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RABGGTBP53611 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RABGGTBP53611 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RABGGTBP53611 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RABGGTBP53611 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RABGGTBP53611 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RABGGTBP53611 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RABGGTBP53611 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RABGGTBP53611 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RABGGTBP53611 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RABGGTBP53611 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RABGGTBP53611 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RABGGTBP53611 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
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