Protein–RNA interactions for Protein: P52306

RAP1GDS1, Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAP1GDS1P52306 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAP1GDS1P52306 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAP1GDS1P52306 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAP1GDS1P52306 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAP1GDS1P52306 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAP1GDS1P52306 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAP1GDS1P52306 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAP1GDS1P52306 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAP1GDS1P52306 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAP1GDS1P52306 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAP1GDS1P52306 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RAP1GDS1P52306 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAP1GDS1P52306 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAP1GDS1P52306 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAP1GDS1P52306 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAP1GDS1P52306 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RAP1GDS1P52306 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAP1GDS1P52306 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAP1GDS1P52306 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAP1GDS1P52306 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RAP1GDS1P52306 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAP1GDS1P52306 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAP1GDS1P52306 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAP1GDS1P52306 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAP1GDS1P52306 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAP1GDS1P52306 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAP1GDS1P52306 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RAP1GDS1P52306 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAP1GDS1P52306 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAP1GDS1P52306 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAP1GDS1P52306 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAP1GDS1P52306 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAP1GDS1P52306 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAP1GDS1P52306 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAP1GDS1P52306 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAP1GDS1P52306 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAP1GDS1P52306 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAP1GDS1P52306 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAP1GDS1P52306 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAP1GDS1P52306 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAP1GDS1P52306 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAP1GDS1P52306 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAP1GDS1P52306 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAP1GDS1P52306 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAP1GDS1P52306 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RAP1GDS1P52306 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAP1GDS1P52306 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAP1GDS1P52306 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RAP1GDS1P52306 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAP1GDS1P52306 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAP1GDS1P52306 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAP1GDS1P52306 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAP1GDS1P52306 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAP1GDS1P52306 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAP1GDS1P52306 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAP1GDS1P52306 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RAP1GDS1P52306 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAP1GDS1P52306 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAP1GDS1P52306 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAP1GDS1P52306 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAP1GDS1P52306 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAP1GDS1P52306 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAP1GDS1P52306 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RAP1GDS1P52306 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAP1GDS1P52306 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAP1GDS1P52306 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RAP1GDS1P52306 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RAP1GDS1P52306 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAP1GDS1P52306 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAP1GDS1P52306 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAP1GDS1P52306 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAP1GDS1P52306 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAP1GDS1P52306 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAP1GDS1P52306 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAP1GDS1P52306 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAP1GDS1P52306 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAP1GDS1P52306 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAP1GDS1P52306 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAP1GDS1P52306 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAP1GDS1P52306 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAP1GDS1P52306 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAP1GDS1P52306 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAP1GDS1P52306 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAP1GDS1P52306 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RAP1GDS1P52306 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAP1GDS1P52306 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAP1GDS1P52306 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAP1GDS1P52306 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAP1GDS1P52306 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAP1GDS1P52306 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAP1GDS1P52306 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAP1GDS1P52306 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAP1GDS1P52306 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAP1GDS1P52306 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAP1GDS1P52306 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAP1GDS1P52306 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAP1GDS1P52306 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RAP1GDS1P52306 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAP1GDS1P52306 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAP1GDS1P52306 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms