Protein–RNA interactions for Protein: P51530

DNA2, DNA replication ATP-dependent helicase/nuclease DNA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNA2P51530 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
DNA2P51530 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DNA2P51530 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DNA2P51530 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DNA2P51530 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DNA2P51530 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNA2P51530 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNA2P51530 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNA2P51530 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNA2P51530 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNA2P51530 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNA2P51530 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNA2P51530 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNA2P51530 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNA2P51530 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DNA2P51530 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DNA2P51530 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DNA2P51530 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DNA2P51530 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DNA2P51530 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DNA2P51530 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DNA2P51530 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DNA2P51530 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
DNA2P51530 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
DNA2P51530 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
DNA2P51530 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
DNA2P51530 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
DNA2P51530 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
DNA2P51530 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DNA2P51530 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNA2P51530 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNA2P51530 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNA2P51530 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNA2P51530 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNA2P51530 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNA2P51530 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNA2P51530 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNA2P51530 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNA2P51530 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNA2P51530 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNA2P51530 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNA2P51530 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
DNA2P51530 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNA2P51530 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNA2P51530 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DNA2P51530 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DNA2P51530 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DNA2P51530 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DNA2P51530 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DNA2P51530 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DNA2P51530 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DNA2P51530 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DNA2P51530 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DNA2P51530 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DNA2P51530 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DNA2P51530 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DNA2P51530 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DNA2P51530 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DNA2P51530 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DNA2P51530 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DNA2P51530 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DNA2P51530 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DNA2P51530 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DNA2P51530 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DNA2P51530 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DNA2P51530 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DNA2P51530 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
DNA2P51530 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DNA2P51530 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DNA2P51530 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DNA2P51530 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DNA2P51530 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DNA2P51530 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
DNA2P51530 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNA2P51530 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNA2P51530 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNA2P51530 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNA2P51530 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNA2P51530 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNA2P51530 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNA2P51530 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNA2P51530 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DNA2P51530 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DNA2P51530 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DNA2P51530 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DNA2P51530 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DNA2P51530 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DNA2P51530 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DNA2P51530 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DNA2P51530 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DNA2P51530 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DNA2P51530 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DNA2P51530 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DNA2P51530 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DNA2P51530 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DNA2P51530 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DNA2P51530 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNA2P51530 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
DNA2P51530 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNA2P51530 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms