Protein–RNA interactions for Protein: P50747

HLCS, Biotin--protein ligase, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLCSP50747 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLCSP50747 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLCSP50747 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLCSP50747 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLCSP50747 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLCSP50747 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLCSP50747 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HLCSP50747 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLCSP50747 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLCSP50747 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLCSP50747 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLCSP50747 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLCSP50747 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLCSP50747 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLCSP50747 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLCSP50747 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLCSP50747 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLCSP50747 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLCSP50747 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HLCSP50747 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLCSP50747 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLCSP50747 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLCSP50747 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLCSP50747 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLCSP50747 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLCSP50747 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLCSP50747 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLCSP50747 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLCSP50747 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLCSP50747 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HLCSP50747 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLCSP50747 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLCSP50747 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLCSP50747 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLCSP50747 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HLCSP50747 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLCSP50747 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLCSP50747 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLCSP50747 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLCSP50747 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLCSP50747 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLCSP50747 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLCSP50747 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLCSP50747 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLCSP50747 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLCSP50747 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLCSP50747 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLCSP50747 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLCSP50747 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLCSP50747 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HLCSP50747 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLCSP50747 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLCSP50747 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLCSP50747 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLCSP50747 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLCSP50747 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HLCSP50747 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLCSP50747 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLCSP50747 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLCSP50747 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLCSP50747 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLCSP50747 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLCSP50747 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLCSP50747 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HLCSP50747 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLCSP50747 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLCSP50747 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLCSP50747 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLCSP50747 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLCSP50747 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLCSP50747 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLCSP50747 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLCSP50747 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HLCSP50747 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLCSP50747 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLCSP50747 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLCSP50747 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLCSP50747 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLCSP50747 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HLCSP50747 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLCSP50747 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLCSP50747 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLCSP50747 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLCSP50747 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLCSP50747 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLCSP50747 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLCSP50747 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLCSP50747 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLCSP50747 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLCSP50747 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLCSP50747 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLCSP50747 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLCSP50747 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLCSP50747 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HLCSP50747 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HLCSP50747 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
HLCSP50747 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HLCSP50747 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HLCSP50747 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HLCSP50747 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms