Protein–RNA interactions for Protein: P50607

TUB, Tubby protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBP50607 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUBP50607 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUBP50607 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUBP50607 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUBP50607 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TUBP50607 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUBP50607 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUBP50607 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBP50607 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBP50607 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBP50607 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBP50607 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBP50607 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBP50607 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBP50607 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBP50607 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBP50607 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBP50607 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBP50607 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBP50607 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBP50607 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBP50607 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBP50607 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBP50607 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBP50607 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBP50607 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBP50607 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBP50607 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBP50607 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBP50607 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBP50607 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBP50607 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBP50607 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBP50607 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBP50607 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBP50607 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBP50607 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBP50607 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBP50607 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBP50607 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBP50607 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBP50607 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBP50607 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBP50607 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBP50607 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBP50607 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBP50607 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBP50607 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBP50607 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBP50607 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBP50607 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBP50607 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBP50607 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBP50607 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBP50607 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBP50607 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBP50607 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBP50607 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBP50607 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBP50607 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBP50607 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBP50607 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBP50607 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBP50607 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBP50607 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBP50607 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBP50607 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBP50607 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBP50607 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBP50607 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBP50607 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBP50607 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBP50607 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBP50607 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBP50607 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBP50607 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBP50607 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBP50607 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBP50607 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBP50607 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBP50607 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBP50607 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBP50607 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBP50607 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBP50607 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBP50607 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TUBP50607 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBP50607 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBP50607 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBP50607 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBP50607 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBP50607 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBP50607 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBP50607 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBP50607 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBP50607 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBP50607 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBP50607 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBP50607 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBP50607 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.7 ms