Protein–RNA interactions for Protein: P49788

RARRES1, Retinoic acid receptor responder protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES1P49788 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
RARRES1P49788 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RARRES1P49788 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RARRES1P49788 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RARRES1P49788 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RARRES1P49788 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RARRES1P49788 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RARRES1P49788 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RARRES1P49788 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RARRES1P49788 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RARRES1P49788 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
RARRES1P49788 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RARRES1P49788 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RARRES1P49788 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RARRES1P49788 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RARRES1P49788 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RARRES1P49788 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RARRES1P49788 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RARRES1P49788 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RARRES1P49788 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
RARRES1P49788 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RARRES1P49788 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RARRES1P49788 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RARRES1P49788 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RARRES1P49788 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RARRES1P49788 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RARRES1P49788 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RARRES1P49788 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RARRES1P49788 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RARRES1P49788 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RARRES1P49788 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RARRES1P49788 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RARRES1P49788 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RARRES1P49788 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RARRES1P49788 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RARRES1P49788 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RARRES1P49788 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RARRES1P49788 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RARRES1P49788 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RARRES1P49788 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RARRES1P49788 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RARRES1P49788 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RARRES1P49788 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RARRES1P49788 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RARRES1P49788 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
RARRES1P49788 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RARRES1P49788 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RARRES1P49788 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RARRES1P49788 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RARRES1P49788 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RARRES1P49788 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RARRES1P49788 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RARRES1P49788 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RARRES1P49788 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RARRES1P49788 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RARRES1P49788 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RARRES1P49788 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RARRES1P49788 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
RARRES1P49788 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RARRES1P49788 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RARRES1P49788 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RARRES1P49788 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RARRES1P49788 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RARRES1P49788 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RARRES1P49788 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RARRES1P49788 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RARRES1P49788 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RARRES1P49788 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RARRES1P49788 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RARRES1P49788 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RARRES1P49788 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RARRES1P49788 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RARRES1P49788 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RARRES1P49788 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RARRES1P49788 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RARRES1P49788 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RARRES1P49788 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RARRES1P49788 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RARRES1P49788 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
RARRES1P49788 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RARRES1P49788 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RARRES1P49788 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RARRES1P49788 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RARRES1P49788 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RARRES1P49788 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RARRES1P49788 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RARRES1P49788 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RARRES1P49788 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RARRES1P49788 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RARRES1P49788 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RARRES1P49788 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RARRES1P49788 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
RARRES1P49788 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RARRES1P49788 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RARRES1P49788 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RARRES1P49788 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RARRES1P49788 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RARRES1P49788 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RARRES1P49788 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RARRES1P49788 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms