Protein–RNA interactions for Protein: P49760

CLK2, Dual specificity protein kinase CLK2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK2P49760 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLK2P49760 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLK2P49760 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLK2P49760 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLK2P49760 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLK2P49760 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLK2P49760 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLK2P49760 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLK2P49760 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CLK2P49760 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLK2P49760 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLK2P49760 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLK2P49760 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLK2P49760 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLK2P49760 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLK2P49760 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLK2P49760 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLK2P49760 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLK2P49760 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLK2P49760 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLK2P49760 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLK2P49760 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLK2P49760 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CLK2P49760 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CLK2P49760 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CLK2P49760 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLK2P49760 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLK2P49760 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLK2P49760 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLK2P49760 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLK2P49760 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLK2P49760 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLK2P49760 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLK2P49760 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLK2P49760 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CLK2P49760 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLK2P49760 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLK2P49760 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLK2P49760 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLK2P49760 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLK2P49760 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLK2P49760 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLK2P49760 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CLK2P49760 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLK2P49760 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLK2P49760 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLK2P49760 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLK2P49760 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLK2P49760 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLK2P49760 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLK2P49760 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLK2P49760 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLK2P49760 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLK2P49760 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CLK2P49760 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLK2P49760 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLK2P49760 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLK2P49760 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLK2P49760 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLK2P49760 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CLK2P49760 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLK2P49760 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLK2P49760 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CLK2P49760 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CLK2P49760 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CLK2P49760 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CLK2P49760 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CLK2P49760 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLK2P49760 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLK2P49760 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLK2P49760 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLK2P49760 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLK2P49760 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLK2P49760 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLK2P49760 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLK2P49760 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLK2P49760 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CLK2P49760 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLK2P49760 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLK2P49760 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLK2P49760 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLK2P49760 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLK2P49760 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLK2P49760 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLK2P49760 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLK2P49760 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLK2P49760 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLK2P49760 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLK2P49760 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLK2P49760 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLK2P49760 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLK2P49760 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CLK2P49760 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLK2P49760 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLK2P49760 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLK2P49760 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLK2P49760 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLK2P49760 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLK2P49760 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLK2P49760 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms