Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSNK1EP49674 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSNK1EP49674 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSNK1EP49674 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSNK1EP49674 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSNK1EP49674 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSNK1EP49674 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSNK1EP49674 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSNK1EP49674 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSNK1EP49674 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSNK1EP49674 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CSNK1EP49674 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSNK1EP49674 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSNK1EP49674 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CSNK1EP49674 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSNK1EP49674 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSNK1EP49674 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSNK1EP49674 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSNK1EP49674 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSNK1EP49674 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSNK1EP49674 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSNK1EP49674 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSNK1EP49674 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSNK1EP49674 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSNK1EP49674 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSNK1EP49674 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSNK1EP49674 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSNK1EP49674 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CSNK1EP49674 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSNK1EP49674 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSNK1EP49674 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSNK1EP49674 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSNK1EP49674 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSNK1EP49674 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSNK1EP49674 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSNK1EP49674 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSNK1EP49674 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSNK1EP49674 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSNK1EP49674 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSNK1EP49674 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSNK1EP49674 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSNK1EP49674 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSNK1EP49674 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSNK1EP49674 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSNK1EP49674 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSNK1EP49674 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSNK1EP49674 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSNK1EP49674 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CSNK1EP49674 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSNK1EP49674 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSNK1EP49674 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSNK1EP49674 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSNK1EP49674 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSNK1EP49674 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSNK1EP49674 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CSNK1EP49674 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CSNK1EP49674 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CSNK1EP49674 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSNK1EP49674 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSNK1EP49674 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSNK1EP49674 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSNK1EP49674 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSNK1EP49674 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSNK1EP49674 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSNK1EP49674 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSNK1EP49674 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSNK1EP49674 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CSNK1EP49674 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSNK1EP49674 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSNK1EP49674 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CSNK1EP49674 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSNK1EP49674 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSNK1EP49674 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSNK1EP49674 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSNK1EP49674 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSNK1EP49674 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSNK1EP49674 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSNK1EP49674 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSNK1EP49674 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CSNK1EP49674 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSNK1EP49674 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSNK1EP49674 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSNK1EP49674 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSNK1EP49674 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSNK1EP49674 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSNK1EP49674 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSNK1EP49674 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSNK1EP49674 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSNK1EP49674 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSNK1EP49674 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSNK1EP49674 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSNK1EP49674 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSNK1EP49674 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSNK1EP49674 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSNK1EP49674 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSNK1EP49674 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSNK1EP49674 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSNK1EP49674 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSNK1EP49674 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSNK1EP49674 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms