Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC11A1P49279 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC11A1P49279 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC11A1P49279 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC11A1P49279 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC11A1P49279 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC11A1P49279 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC11A1P49279 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC11A1P49279 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC11A1P49279 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC11A1P49279 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC11A1P49279 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC11A1P49279 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC11A1P49279 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC11A1P49279 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC11A1P49279 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC11A1P49279 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC11A1P49279 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC11A1P49279 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC11A1P49279 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC11A1P49279 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC11A1P49279 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC11A1P49279 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC11A1P49279 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC11A1P49279 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC11A1P49279 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC11A1P49279 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC11A1P49279 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC11A1P49279 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC11A1P49279 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC11A1P49279 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC11A1P49279 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC11A1P49279 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC11A1P49279 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC11A1P49279 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC11A1P49279 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC11A1P49279 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLC11A1P49279 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC11A1P49279 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC11A1P49279 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC11A1P49279 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC11A1P49279 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC11A1P49279 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC11A1P49279 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC11A1P49279 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC11A1P49279 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC11A1P49279 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC11A1P49279 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC11A1P49279 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC11A1P49279 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC11A1P49279 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC11A1P49279 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC11A1P49279 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC11A1P49279 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC11A1P49279 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC11A1P49279 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC11A1P49279 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC11A1P49279 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC11A1P49279 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC11A1P49279 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC11A1P49279 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC11A1P49279 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC11A1P49279 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC11A1P49279 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC11A1P49279 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC11A1P49279 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC11A1P49279 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC11A1P49279 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC11A1P49279 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC11A1P49279 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC11A1P49279 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC11A1P49279 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC11A1P49279 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC11A1P49279 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC11A1P49279 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC11A1P49279 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC11A1P49279 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC11A1P49279 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC11A1P49279 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC11A1P49279 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC11A1P49279 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC11A1P49279 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC11A1P49279 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC11A1P49279 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC11A1P49279 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC11A1P49279 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC11A1P49279 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC11A1P49279 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC11A1P49279 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC11A1P49279 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC11A1P49279 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC11A1P49279 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC11A1P49279 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC11A1P49279 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC11A1P49279 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC11A1P49279 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC11A1P49279 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC11A1P49279 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC11A1P49279 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC11A1P49279 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms