Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PIP4K2AP48426 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PIP4K2AP48426 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PIP4K2AP48426 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PIP4K2AP48426 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PIP4K2AP48426 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PIP4K2AP48426 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PIP4K2AP48426 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PIP4K2AP48426 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PIP4K2AP48426 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PIP4K2AP48426 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PIP4K2AP48426 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PIP4K2AP48426 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PIP4K2AP48426 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PIP4K2AP48426 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PIP4K2AP48426 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PIP4K2AP48426 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
PIP4K2AP48426 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PIP4K2AP48426 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PIP4K2AP48426 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PIP4K2AP48426 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PIP4K2AP48426 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PIP4K2AP48426 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PIP4K2AP48426 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PIP4K2AP48426 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PIP4K2AP48426 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PIP4K2AP48426 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PIP4K2AP48426 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PIP4K2AP48426 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PIP4K2AP48426 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PIP4K2AP48426 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PIP4K2AP48426 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PIP4K2AP48426 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PIP4K2AP48426 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PIP4K2AP48426 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PIP4K2AP48426 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PIP4K2AP48426 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PIP4K2AP48426 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PIP4K2AP48426 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PIP4K2AP48426 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PIP4K2AP48426 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
PIP4K2AP48426 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PIP4K2AP48426 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PIP4K2AP48426 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PIP4K2AP48426 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PIP4K2AP48426 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PIP4K2AP48426 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PIP4K2AP48426 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PIP4K2AP48426 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
PIP4K2AP48426 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PIP4K2AP48426 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PIP4K2AP48426 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PIP4K2AP48426 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PIP4K2AP48426 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PIP4K2AP48426 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PIP4K2AP48426 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PIP4K2AP48426 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PIP4K2AP48426 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PIP4K2AP48426 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
PIP4K2AP48426 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
PIP4K2AP48426 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PIP4K2AP48426 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PIP4K2AP48426 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PIP4K2AP48426 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PIP4K2AP48426 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PIP4K2AP48426 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PIP4K2AP48426 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PIP4K2AP48426 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PIP4K2AP48426 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
PIP4K2AP48426 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PIP4K2AP48426 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PIP4K2AP48426 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PIP4K2AP48426 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PIP4K2AP48426 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PIP4K2AP48426 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PIP4K2AP48426 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PIP4K2AP48426 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PIP4K2AP48426 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PIP4K2AP48426 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PIP4K2AP48426 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PIP4K2AP48426 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PIP4K2AP48426 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PIP4K2AP48426 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PIP4K2AP48426 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PIP4K2AP48426 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PIP4K2AP48426 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
PIP4K2AP48426 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
PIP4K2AP48426 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PIP4K2AP48426 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PIP4K2AP48426 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PIP4K2AP48426 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PIP4K2AP48426 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PIP4K2AP48426 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
PIP4K2AP48426 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PIP4K2AP48426 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
PIP4K2AP48426 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PIP4K2AP48426 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PIP4K2AP48426 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PIP4K2AP48426 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PIP4K2AP48426 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms