Protein–RNA interactions for Protein: P47914

RPL29, 60S ribosomal protein L29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL29P47914 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL29P47914 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL29P47914 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL29P47914 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL29P47914 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL29P47914 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL29P47914 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL29P47914 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL29P47914 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL29P47914 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL29P47914 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL29P47914 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL29P47914 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL29P47914 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL29P47914 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL29P47914 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL29P47914 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL29P47914 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL29P47914 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL29P47914 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL29P47914 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL29P47914 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL29P47914 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL29P47914 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL29P47914 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL29P47914 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL29P47914 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPL29P47914 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPL29P47914 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPL29P47914 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPL29P47914 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPL29P47914 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPL29P47914 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPL29P47914 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPL29P47914 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPL29P47914 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPL29P47914 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPL29P47914 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPL29P47914 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPL29P47914 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPL29P47914 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPL29P47914 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL29P47914 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL29P47914 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL29P47914 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL29P47914 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL29P47914 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL29P47914 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL29P47914 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL29P47914 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL29P47914 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL29P47914 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL29P47914 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL29P47914 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL29P47914 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL29P47914 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL29P47914 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL29P47914 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL29P47914 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL29P47914 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL29P47914 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL29P47914 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL29P47914 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL29P47914 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL29P47914 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL29P47914 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL29P47914 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL29P47914 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL29P47914 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL29P47914 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL29P47914 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL29P47914 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL29P47914 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL29P47914 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL29P47914 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL29P47914 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL29P47914 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL29P47914 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL29P47914 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL29P47914 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL29P47914 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL29P47914 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL29P47914 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL29P47914 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL29P47914 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL29P47914 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL29P47914 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL29P47914 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL29P47914 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL29P47914 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL29P47914 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL29P47914 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL29P47914 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL29P47914 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL29P47914 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL29P47914 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL29P47914 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL29P47914 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL29P47914 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL29P47914 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms