Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XCR1P46094 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XCR1P46094 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XCR1P46094 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XCR1P46094 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
XCR1P46094 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XCR1P46094 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
XCR1P46094 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
XCR1P46094 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XCR1P46094 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XCR1P46094 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
XCR1P46094 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
XCR1P46094 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XCR1P46094 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
XCR1P46094 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XCR1P46094 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
XCR1P46094 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
XCR1P46094 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XCR1P46094 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XCR1P46094 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XCR1P46094 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XCR1P46094 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XCR1P46094 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XCR1P46094 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XCR1P46094 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XCR1P46094 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XCR1P46094 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XCR1P46094 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XCR1P46094 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
XCR1P46094 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
XCR1P46094 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XCR1P46094 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XCR1P46094 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XCR1P46094 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XCR1P46094 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XCR1P46094 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
XCR1P46094 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
XCR1P46094 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XCR1P46094 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XCR1P46094 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XCR1P46094 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XCR1P46094 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XCR1P46094 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
XCR1P46094 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XCR1P46094 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XCR1P46094 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XCR1P46094 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XCR1P46094 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XCR1P46094 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
XCR1P46094 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
XCR1P46094 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
XCR1P46094 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
XCR1P46094 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XCR1P46094 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XCR1P46094 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
XCR1P46094 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XCR1P46094 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XCR1P46094 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XCR1P46094 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XCR1P46094 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XCR1P46094 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XCR1P46094 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XCR1P46094 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XCR1P46094 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XCR1P46094 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
XCR1P46094 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XCR1P46094 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XCR1P46094 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XCR1P46094 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XCR1P46094 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XCR1P46094 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
XCR1P46094 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XCR1P46094 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XCR1P46094 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
XCR1P46094 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XCR1P46094 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XCR1P46094 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
XCR1P46094 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XCR1P46094 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XCR1P46094 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XCR1P46094 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XCR1P46094 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XCR1P46094 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XCR1P46094 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XCR1P46094 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XCR1P46094 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XCR1P46094 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XCR1P46094 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XCR1P46094 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XCR1P46094 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XCR1P46094 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
XCR1P46094 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
XCR1P46094 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
XCR1P46094 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
XCR1P46094 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
XCR1P46094 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
XCR1P46094 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
XCR1P46094 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
XCR1P46094 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
XCR1P46094 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms