Protein–RNA interactions for Protein: P43405

SYK, Tyrosine-protein kinase SYK, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYKP43405 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYKP43405 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYKP43405 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYKP43405 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYKP43405 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYKP43405 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYKP43405 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYKP43405 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYKP43405 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYKP43405 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYKP43405 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYKP43405 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYKP43405 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYKP43405 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYKP43405 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYKP43405 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYKP43405 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYKP43405 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SYKP43405 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYKP43405 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYKP43405 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYKP43405 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYKP43405 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYKP43405 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SYKP43405 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYKP43405 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYKP43405 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SYKP43405 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYKP43405 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYKP43405 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SYKP43405 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SYKP43405 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SYKP43405 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYKP43405 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYKP43405 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYKP43405 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYKP43405 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYKP43405 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYKP43405 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYKP43405 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYKP43405 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYKP43405 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SYKP43405 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYKP43405 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYKP43405 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYKP43405 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYKP43405 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYKP43405 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYKP43405 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SYKP43405 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYKP43405 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYKP43405 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYKP43405 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYKP43405 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYKP43405 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYKP43405 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYKP43405 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYKP43405 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYKP43405 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYKP43405 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYKP43405 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYKP43405 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYKP43405 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYKP43405 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYKP43405 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYKP43405 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYKP43405 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYKP43405 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYKP43405 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYKP43405 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
SYKP43405 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYKP43405 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYKP43405 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYKP43405 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SYKP43405 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYKP43405 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYKP43405 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYKP43405 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYKP43405 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYKP43405 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYKP43405 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYKP43405 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYKP43405 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYKP43405 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYKP43405 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYKP43405 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYKP43405 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYKP43405 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYKP43405 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYKP43405 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYKP43405 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYKP43405 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYKP43405 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYKP43405 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYKP43405 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYKP43405 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SYKP43405 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYKP43405 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYKP43405 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYKP43405 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms