Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARL1P40616 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARL1P40616 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARL1P40616 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARL1P40616 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARL1P40616 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARL1P40616 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARL1P40616 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARL1P40616 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARL1P40616 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARL1P40616 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARL1P40616 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARL1P40616 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARL1P40616 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARL1P40616 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARL1P40616 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARL1P40616 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARL1P40616 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARL1P40616 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARL1P40616 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARL1P40616 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARL1P40616 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARL1P40616 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARL1P40616 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARL1P40616 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARL1P40616 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ARL1P40616 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ARL1P40616 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARL1P40616 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARL1P40616 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARL1P40616 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARL1P40616 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARL1P40616 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARL1P40616 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARL1P40616 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARL1P40616 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARL1P40616 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARL1P40616 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARL1P40616 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARL1P40616 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARL1P40616 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARL1P40616 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARL1P40616 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARL1P40616 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARL1P40616 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARL1P40616 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARL1P40616 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARL1P40616 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARL1P40616 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARL1P40616 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARL1P40616 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARL1P40616 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARL1P40616 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARL1P40616 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARL1P40616 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARL1P40616 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ARL1P40616 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARL1P40616 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARL1P40616 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARL1P40616 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARL1P40616 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARL1P40616 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARL1P40616 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARL1P40616 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARL1P40616 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARL1P40616 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARL1P40616 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARL1P40616 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARL1P40616 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARL1P40616 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARL1P40616 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARL1P40616 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARL1P40616 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARL1P40616 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARL1P40616 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARL1P40616 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARL1P40616 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARL1P40616 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARL1P40616 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARL1P40616 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARL1P40616 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARL1P40616 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARL1P40616 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARL1P40616 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARL1P40616 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARL1P40616 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARL1P40616 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARL1P40616 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARL1P40616 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARL1P40616 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARL1P40616 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARL1P40616 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARL1P40616 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARL1P40616 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ARL1P40616 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARL1P40616 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARL1P40616 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARL1P40616 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARL1P40616 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ARL1P40616 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms