Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PBX2P40425 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PBX2P40425 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PBX2P40425 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PBX2P40425 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PBX2P40425 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PBX2P40425 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PBX2P40425 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PBX2P40425 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PBX2P40425 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PBX2P40425 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PBX2P40425 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PBX2P40425 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PBX2P40425 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PBX2P40425 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PBX2P40425 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PBX2P40425 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PBX2P40425 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PBX2P40425 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PBX2P40425 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PBX2P40425 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PBX2P40425 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PBX2P40425 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PBX2P40425 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PBX2P40425 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PBX2P40425 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PBX2P40425 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PBX2P40425 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PBX2P40425 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PBX2P40425 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PBX2P40425 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PBX2P40425 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PBX2P40425 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PBX2P40425 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PBX2P40425 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PBX2P40425 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PBX2P40425 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PBX2P40425 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PBX2P40425 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PBX2P40425 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PBX2P40425 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PBX2P40425 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PBX2P40425 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PBX2P40425 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PBX2P40425 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PBX2P40425 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PBX2P40425 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PBX2P40425 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PBX2P40425 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PBX2P40425 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PBX2P40425 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PBX2P40425 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PBX2P40425 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PBX2P40425 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PBX2P40425 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PBX2P40425 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PBX2P40425 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PBX2P40425 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PBX2P40425 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PBX2P40425 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PBX2P40425 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PBX2P40425 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PBX2P40425 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PBX2P40425 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PBX2P40425 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PBX2P40425 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PBX2P40425 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PBX2P40425 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PBX2P40425 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PBX2P40425 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PBX2P40425 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PBX2P40425 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PBX2P40425 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PBX2P40425 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PBX2P40425 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PBX2P40425 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PBX2P40425 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PBX2P40425 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PBX2P40425 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PBX2P40425 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PBX2P40425 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PBX2P40425 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PBX2P40425 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PBX2P40425 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PBX2P40425 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PBX2P40425 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PBX2P40425 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PBX2P40425 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PBX2P40425 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PBX2P40425 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PBX2P40425 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PBX2P40425 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PBX2P40425 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PBX2P40425 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PBX2P40425 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PBX2P40425 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PBX2P40425 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PBX2P40425 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PBX2P40425 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PBX2P40425 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms