Protein–RNA interactions for Protein: P38432

COIL, Coilin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COILP38432 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COILP38432 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COILP38432 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COILP38432 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COILP38432 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COILP38432 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COILP38432 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COILP38432 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COILP38432 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COILP38432 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COILP38432 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COILP38432 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COILP38432 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COILP38432 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COILP38432 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COILP38432 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COILP38432 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COILP38432 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COILP38432 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
COILP38432 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COILP38432 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COILP38432 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COILP38432 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COILP38432 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COILP38432 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COILP38432 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COILP38432 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COILP38432 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COILP38432 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COILP38432 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COILP38432 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COILP38432 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COILP38432 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COILP38432 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COILP38432 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COILP38432 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COILP38432 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
COILP38432 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
COILP38432 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
COILP38432 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
COILP38432 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
COILP38432 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
COILP38432 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COILP38432 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COILP38432 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COILP38432 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COILP38432 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COILP38432 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COILP38432 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COILP38432 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COILP38432 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COILP38432 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COILP38432 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COILP38432 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COILP38432 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COILP38432 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COILP38432 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COILP38432 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COILP38432 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COILP38432 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
COILP38432 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COILP38432 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
COILP38432 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COILP38432 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COILP38432 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COILP38432 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COILP38432 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COILP38432 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COILP38432 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COILP38432 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COILP38432 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COILP38432 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COILP38432 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COILP38432 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COILP38432 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COILP38432 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COILP38432 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COILP38432 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COILP38432 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COILP38432 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COILP38432 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COILP38432 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COILP38432 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COILP38432 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COILP38432 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COILP38432 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COILP38432 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
COILP38432 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
COILP38432 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
COILP38432 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COILP38432 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COILP38432 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COILP38432 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COILP38432 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COILP38432 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COILP38432 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COILP38432 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COILP38432 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COILP38432 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COILP38432 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms