Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FDFT1P37268 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FDFT1P37268 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FDFT1P37268 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FDFT1P37268 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FDFT1P37268 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FDFT1P37268 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
FDFT1P37268 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FDFT1P37268 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FDFT1P37268 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FDFT1P37268 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FDFT1P37268 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
FDFT1P37268 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FDFT1P37268 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FDFT1P37268 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FDFT1P37268 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FDFT1P37268 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FDFT1P37268 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FDFT1P37268 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FDFT1P37268 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FDFT1P37268 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FDFT1P37268 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FDFT1P37268 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FDFT1P37268 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FDFT1P37268 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FDFT1P37268 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FDFT1P37268 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FDFT1P37268 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
FDFT1P37268 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FDFT1P37268 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FDFT1P37268 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FDFT1P37268 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FDFT1P37268 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FDFT1P37268 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FDFT1P37268 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FDFT1P37268 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FDFT1P37268 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FDFT1P37268 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FDFT1P37268 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FDFT1P37268 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FDFT1P37268 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FDFT1P37268 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FDFT1P37268 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FDFT1P37268 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FDFT1P37268 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FDFT1P37268 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FDFT1P37268 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FDFT1P37268 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FDFT1P37268 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FDFT1P37268 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FDFT1P37268 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FDFT1P37268 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FDFT1P37268 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FDFT1P37268 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FDFT1P37268 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FDFT1P37268 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FDFT1P37268 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FDFT1P37268 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FDFT1P37268 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FDFT1P37268 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FDFT1P37268 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FDFT1P37268 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FDFT1P37268 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FDFT1P37268 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FDFT1P37268 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FDFT1P37268 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FDFT1P37268 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FDFT1P37268 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FDFT1P37268 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
FDFT1P37268 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
FDFT1P37268 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
FDFT1P37268 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FDFT1P37268 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FDFT1P37268 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FDFT1P37268 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FDFT1P37268 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FDFT1P37268 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FDFT1P37268 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FDFT1P37268 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FDFT1P37268 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FDFT1P37268 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FDFT1P37268 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FDFT1P37268 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FDFT1P37268 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FDFT1P37268 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FDFT1P37268 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FDFT1P37268 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FDFT1P37268 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FDFT1P37268 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FDFT1P37268 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FDFT1P37268 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FDFT1P37268 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FDFT1P37268 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FDFT1P37268 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FDFT1P37268 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FDFT1P37268 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FDFT1P37268 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FDFT1P37268 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FDFT1P37268 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FDFT1P37268 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms