Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXD13P35453 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXD13P35453 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXD13P35453 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXD13P35453 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXD13P35453 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXD13P35453 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXD13P35453 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXD13P35453 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXD13P35453 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXD13P35453 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
HOXD13P35453 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXD13P35453 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXD13P35453 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXD13P35453 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXD13P35453 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXD13P35453 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXD13P35453 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXD13P35453 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXD13P35453 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXD13P35453 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXD13P35453 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXD13P35453 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXD13P35453 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXD13P35453 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXD13P35453 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXD13P35453 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXD13P35453 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXD13P35453 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXD13P35453 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXD13P35453 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXD13P35453 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXD13P35453 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXD13P35453 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXD13P35453 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXD13P35453 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXD13P35453 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXD13P35453 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXD13P35453 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXD13P35453 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXD13P35453 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXD13P35453 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXD13P35453 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXD13P35453 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXD13P35453 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXD13P35453 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXD13P35453 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXD13P35453 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXD13P35453 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXD13P35453 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXD13P35453 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXD13P35453 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXD13P35453 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXD13P35453 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXD13P35453 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXD13P35453 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXD13P35453 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXD13P35453 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXD13P35453 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXD13P35453 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXD13P35453 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXD13P35453 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXD13P35453 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXD13P35453 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
HOXD13P35453 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXD13P35453 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXD13P35453 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXD13P35453 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXD13P35453 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXD13P35453 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXD13P35453 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXD13P35453 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXD13P35453 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXD13P35453 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXD13P35453 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXD13P35453 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXD13P35453 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXD13P35453 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXD13P35453 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXD13P35453 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXD13P35453 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXD13P35453 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXD13P35453 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXD13P35453 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXD13P35453 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXD13P35453 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXD13P35453 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXD13P35453 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXD13P35453 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXD13P35453 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXD13P35453 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXD13P35453 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXD13P35453 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXD13P35453 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXD13P35453 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXD13P35453 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXD13P35453 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXD13P35453 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXD13P35453 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXD13P35453 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms