Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTNNB1P35222 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CTNNB1P35222 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTNNB1P35222 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTNNB1P35222 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTNNB1P35222 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTNNB1P35222 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTNNB1P35222 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTNNB1P35222 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTNNB1P35222 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTNNB1P35222 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTNNB1P35222 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTNNB1P35222 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTNNB1P35222 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CTNNB1P35222 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTNNB1P35222 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTNNB1P35222 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTNNB1P35222 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTNNB1P35222 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTNNB1P35222 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTNNB1P35222 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTNNB1P35222 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTNNB1P35222 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTNNB1P35222 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CTNNB1P35222 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTNNB1P35222 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTNNB1P35222 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTNNB1P35222 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTNNB1P35222 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTNNB1P35222 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CTNNB1P35222 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTNNB1P35222 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTNNB1P35222 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTNNB1P35222 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTNNB1P35222 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTNNB1P35222 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTNNB1P35222 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTNNB1P35222 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTNNB1P35222 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTNNB1P35222 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTNNB1P35222 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTNNB1P35222 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTNNB1P35222 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CTNNB1P35222 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTNNB1P35222 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTNNB1P35222 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTNNB1P35222 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTNNB1P35222 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTNNB1P35222 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CTNNB1P35222 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTNNB1P35222 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CTNNB1P35222 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTNNB1P35222 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTNNB1P35222 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTNNB1P35222 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTNNB1P35222 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTNNB1P35222 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTNNB1P35222 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTNNB1P35222 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CTNNB1P35222 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTNNB1P35222 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTNNB1P35222 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTNNB1P35222 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTNNB1P35222 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTNNB1P35222 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTNNB1P35222 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTNNB1P35222 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTNNB1P35222 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTNNB1P35222 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTNNB1P35222 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTNNB1P35222 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTNNB1P35222 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTNNB1P35222 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTNNB1P35222 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTNNB1P35222 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTNNB1P35222 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTNNB1P35222 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTNNB1P35222 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTNNB1P35222 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTNNB1P35222 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CTNNB1P35222 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTNNB1P35222 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTNNB1P35222 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTNNB1P35222 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTNNB1P35222 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTNNB1P35222 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTNNB1P35222 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTNNB1P35222 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CTNNB1P35222 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTNNB1P35222 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CTNNB1P35222 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CTNNB1P35222 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTNNB1P35222 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTNNB1P35222 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTNNB1P35222 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTNNB1P35222 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTNNB1P35222 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CTNNB1P35222 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTNNB1P35222 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTNNB1P35222 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms