Protein–RNA interactions for Protein: P33991

MCM4, DNA replication licensing factor MCM4, humanhuman

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM4P33991 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MCM4P33991 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MCM4P33991 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MCM4P33991 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
MCM4P33991 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MCM4P33991 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MCM4P33991 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MCM4P33991 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MCM4P33991 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MCM4P33991 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MCM4P33991 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MCM4P33991 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MCM4P33991 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MCM4P33991 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
MCM4P33991 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MCM4P33991 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MCM4P33991 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MCM4P33991 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MCM4P33991 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MCM4P33991 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MCM4P33991 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MCM4P33991 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MCM4P33991 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
MCM4P33991 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MCM4P33991 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MCM4P33991 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MCM4P33991 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MCM4P33991 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MCM4P33991 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MCM4P33991 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MCM4P33991 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MCM4P33991 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MCM4P33991 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MCM4P33991 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MCM4P33991 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MCM4P33991 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MCM4P33991 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MCM4P33991 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MCM4P33991 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MCM4P33991 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MCM4P33991 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MCM4P33991 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MCM4P33991 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MCM4P33991 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MCM4P33991 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MCM4P33991 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MCM4P33991 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MCM4P33991 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MCM4P33991 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MCM4P33991 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MCM4P33991 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
MCM4P33991 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MCM4P33991 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MCM4P33991 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MCM4P33991 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MCM4P33991 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MCM4P33991 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MCM4P33991 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MCM4P33991 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MCM4P33991 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MCM4P33991 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MCM4P33991 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MCM4P33991 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MCM4P33991 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MCM4P33991 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MCM4P33991 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MCM4P33991 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MCM4P33991 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MCM4P33991 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MCM4P33991 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MCM4P33991 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MCM4P33991 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MCM4P33991 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MCM4P33991 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MCM4P33991 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MCM4P33991 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MCM4P33991 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MCM4P33991 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MCM4P33991 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MCM4P33991 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MCM4P33991 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MCM4P33991 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MCM4P33991 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MCM4P33991 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MCM4P33991 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MCM4P33991 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MCM4P33991 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MCM4P33991 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MCM4P33991 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MCM4P33991 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MCM4P33991 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MCM4P33991 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MCM4P33991 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
MCM4P33991 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
MCM4P33991 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MCM4P33991 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
MCM4P33991 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MCM4P33991 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MCM4P33991 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MCM4P33991 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms