Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXA9P31269 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXA9P31269 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXA9P31269 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXA9P31269 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXA9P31269 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXA9P31269 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXA9P31269 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXA9P31269 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXA9P31269 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXA9P31269 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXA9P31269 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXA9P31269 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXA9P31269 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXA9P31269 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXA9P31269 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXA9P31269 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXA9P31269 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXA9P31269 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
HOXA9P31269 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXA9P31269 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXA9P31269 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXA9P31269 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXA9P31269 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXA9P31269 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXA9P31269 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXA9P31269 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXA9P31269 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXA9P31269 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXA9P31269 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXA9P31269 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA9P31269 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA9P31269 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA9P31269 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA9P31269 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA9P31269 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA9P31269 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA9P31269 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA9P31269 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXA9P31269 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXA9P31269 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXA9P31269 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXA9P31269 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXA9P31269 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXA9P31269 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXA9P31269 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXA9P31269 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXA9P31269 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXA9P31269 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXA9P31269 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXA9P31269 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXA9P31269 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXA9P31269 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXA9P31269 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXA9P31269 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXA9P31269 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXA9P31269 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXA9P31269 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXA9P31269 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXA9P31269 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXA9P31269 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXA9P31269 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXA9P31269 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXA9P31269 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXA9P31269 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXA9P31269 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXA9P31269 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXA9P31269 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXA9P31269 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXA9P31269 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXA9P31269 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXA9P31269 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXA9P31269 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXA9P31269 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXA9P31269 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXA9P31269 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXA9P31269 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXA9P31269 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXA9P31269 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXA9P31269 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXA9P31269 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXA9P31269 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXA9P31269 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXA9P31269 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXA9P31269 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXA9P31269 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXA9P31269 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXA9P31269 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXA9P31269 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXA9P31269 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXA9P31269 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXA9P31269 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXA9P31269 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXA9P31269 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXA9P31269 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXA9P31269 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXA9P31269 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXA9P31269 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXA9P31269 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXA9P31269 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms