Protein–RNA interactions for Protein: P29558

RBMS1, RNA-binding motif, single-stranded-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBMS1P29558 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RBMS1P29558 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RBMS1P29558 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RBMS1P29558 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBMS1P29558 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBMS1P29558 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RBMS1P29558 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBMS1P29558 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBMS1P29558 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBMS1P29558 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBMS1P29558 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBMS1P29558 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBMS1P29558 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBMS1P29558 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBMS1P29558 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBMS1P29558 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBMS1P29558 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBMS1P29558 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBMS1P29558 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBMS1P29558 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBMS1P29558 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBMS1P29558 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBMS1P29558 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RBMS1P29558 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBMS1P29558 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBMS1P29558 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBMS1P29558 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBMS1P29558 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBMS1P29558 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBMS1P29558 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBMS1P29558 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBMS1P29558 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBMS1P29558 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBMS1P29558 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBMS1P29558 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBMS1P29558 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBMS1P29558 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBMS1P29558 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBMS1P29558 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBMS1P29558 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBMS1P29558 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBMS1P29558 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBMS1P29558 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBMS1P29558 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RBMS1P29558 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBMS1P29558 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBMS1P29558 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBMS1P29558 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBMS1P29558 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBMS1P29558 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBMS1P29558 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBMS1P29558 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBMS1P29558 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBMS1P29558 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBMS1P29558 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBMS1P29558 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBMS1P29558 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBMS1P29558 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBMS1P29558 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBMS1P29558 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBMS1P29558 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBMS1P29558 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RBMS1P29558 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBMS1P29558 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RBMS1P29558 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RBMS1P29558 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RBMS1P29558 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBMS1P29558 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBMS1P29558 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBMS1P29558 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBMS1P29558 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBMS1P29558 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBMS1P29558 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBMS1P29558 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RBMS1P29558 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBMS1P29558 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBMS1P29558 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBMS1P29558 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBMS1P29558 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBMS1P29558 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBMS1P29558 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBMS1P29558 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBMS1P29558 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RBMS1P29558 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBMS1P29558 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBMS1P29558 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBMS1P29558 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBMS1P29558 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBMS1P29558 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBMS1P29558 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBMS1P29558 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBMS1P29558 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBMS1P29558 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBMS1P29558 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBMS1P29558 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBMS1P29558 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBMS1P29558 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBMS1P29558 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBMS1P29558 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBMS1P29558 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166.6 ms