Protein–RNA interactions for Protein: P29508

SERPINB3, Serpin B3, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINB3P29508 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SERPINB3P29508 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SERPINB3P29508 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SERPINB3P29508 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SERPINB3P29508 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SERPINB3P29508 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SERPINB3P29508 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SERPINB3P29508 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SERPINB3P29508 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SERPINB3P29508 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SERPINB3P29508 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SERPINB3P29508 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SERPINB3P29508 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SERPINB3P29508 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SERPINB3P29508 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SERPINB3P29508 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SERPINB3P29508 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SERPINB3P29508 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SERPINB3P29508 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SERPINB3P29508 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SERPINB3P29508 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SERPINB3P29508 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SERPINB3P29508 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SERPINB3P29508 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SERPINB3P29508 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SERPINB3P29508 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SERPINB3P29508 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SERPINB3P29508 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SERPINB3P29508 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SERPINB3P29508 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SERPINB3P29508 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SERPINB3P29508 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SERPINB3P29508 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SERPINB3P29508 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SERPINB3P29508 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SERPINB3P29508 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SERPINB3P29508 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SERPINB3P29508 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SERPINB3P29508 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SERPINB3P29508 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SERPINB3P29508 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SERPINB3P29508 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SERPINB3P29508 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SERPINB3P29508 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SERPINB3P29508 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SERPINB3P29508 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SERPINB3P29508 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SERPINB3P29508 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SERPINB3P29508 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SERPINB3P29508 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SERPINB3P29508 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SERPINB3P29508 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SERPINB3P29508 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SERPINB3P29508 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SERPINB3P29508 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SERPINB3P29508 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SERPINB3P29508 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SERPINB3P29508 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SERPINB3P29508 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SERPINB3P29508 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SERPINB3P29508 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SERPINB3P29508 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SERPINB3P29508 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SERPINB3P29508 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SERPINB3P29508 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SERPINB3P29508 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SERPINB3P29508 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SERPINB3P29508 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SERPINB3P29508 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SERPINB3P29508 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SERPINB3P29508 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SERPINB3P29508 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SERPINB3P29508 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SERPINB3P29508 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SERPINB3P29508 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SERPINB3P29508 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SERPINB3P29508 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SERPINB3P29508 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SERPINB3P29508 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SERPINB3P29508 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SERPINB3P29508 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SERPINB3P29508 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SERPINB3P29508 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SERPINB3P29508 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SERPINB3P29508 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SERPINB3P29508 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SERPINB3P29508 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SERPINB3P29508 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SERPINB3P29508 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SERPINB3P29508 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SERPINB3P29508 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SERPINB3P29508 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SERPINB3P29508 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SERPINB3P29508 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SERPINB3P29508 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SERPINB3P29508 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SERPINB3P29508 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SERPINB3P29508 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SERPINB3P29508 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SERPINB3P29508 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 190.6 ms