Protein–RNA interactions for Protein: P29120

PCSK1, Neuroendocrine convertase 1, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1P29120 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCSK1P29120 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCSK1P29120 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCSK1P29120 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PCSK1P29120 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCSK1P29120 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCSK1P29120 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCSK1P29120 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCSK1P29120 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCSK1P29120 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCSK1P29120 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCSK1P29120 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCSK1P29120 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCSK1P29120 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCSK1P29120 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCSK1P29120 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCSK1P29120 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCSK1P29120 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCSK1P29120 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCSK1P29120 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCSK1P29120 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCSK1P29120 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCSK1P29120 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCSK1P29120 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCSK1P29120 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCSK1P29120 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCSK1P29120 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCSK1P29120 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCSK1P29120 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCSK1P29120 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCSK1P29120 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCSK1P29120 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCSK1P29120 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PCSK1P29120 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PCSK1P29120 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PCSK1P29120 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCSK1P29120 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCSK1P29120 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCSK1P29120 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCSK1P29120 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCSK1P29120 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PCSK1P29120 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCSK1P29120 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCSK1P29120 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCSK1P29120 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCSK1P29120 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCSK1P29120 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCSK1P29120 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCSK1P29120 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCSK1P29120 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCSK1P29120 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCSK1P29120 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCSK1P29120 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCSK1P29120 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCSK1P29120 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCSK1P29120 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCSK1P29120 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCSK1P29120 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCSK1P29120 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCSK1P29120 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCSK1P29120 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCSK1P29120 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PCSK1P29120 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCSK1P29120 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PCSK1P29120 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCSK1P29120 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCSK1P29120 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCSK1P29120 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCSK1P29120 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCSK1P29120 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCSK1P29120 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCSK1P29120 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PCSK1P29120 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCSK1P29120 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCSK1P29120 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCSK1P29120 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCSK1P29120 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PCSK1P29120 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCSK1P29120 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PCSK1P29120 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCSK1P29120 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCSK1P29120 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCSK1P29120 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PCSK1P29120 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCSK1P29120 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCSK1P29120 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCSK1P29120 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCSK1P29120 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PCSK1P29120 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PCSK1P29120 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCSK1P29120 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PCSK1P29120 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCSK1P29120 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCSK1P29120 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCSK1P29120 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCSK1P29120 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PCSK1P29120 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCSK1P29120 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCSK1P29120 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PCSK1P29120 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.6 ms