Protein–RNA interactions for Protein: P28908

TNFRSF8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF8P28908 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFRSF8P28908 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFRSF8P28908 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFRSF8P28908 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFRSF8P28908 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFRSF8P28908 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFRSF8P28908 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNFRSF8P28908 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNFRSF8P28908 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
TNFRSF8P28908 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNFRSF8P28908 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNFRSF8P28908 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TNFRSF8P28908 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNFRSF8P28908 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TNFRSF8P28908 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNFRSF8P28908 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNFRSF8P28908 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNFRSF8P28908 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFRSF8P28908 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFRSF8P28908 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFRSF8P28908 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFRSF8P28908 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFRSF8P28908 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFRSF8P28908 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFRSF8P28908 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFRSF8P28908 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFRSF8P28908 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFRSF8P28908 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNFRSF8P28908 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNFRSF8P28908 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNFRSF8P28908 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNFRSF8P28908 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNFRSF8P28908 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNFRSF8P28908 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFRSF8P28908 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFRSF8P28908 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFRSF8P28908 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFRSF8P28908 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFRSF8P28908 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFRSF8P28908 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFRSF8P28908 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFRSF8P28908 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFRSF8P28908 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFRSF8P28908 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFRSF8P28908 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFRSF8P28908 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFRSF8P28908 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFRSF8P28908 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFRSF8P28908 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFRSF8P28908 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNFRSF8P28908 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNFRSF8P28908 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNFRSF8P28908 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNFRSF8P28908 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNFRSF8P28908 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNFRSF8P28908 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNFRSF8P28908 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TNFRSF8P28908 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNFRSF8P28908 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNFRSF8P28908 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNFRSF8P28908 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNFRSF8P28908 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TNFRSF8P28908 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNFRSF8P28908 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNFRSF8P28908 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNFRSF8P28908 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNFRSF8P28908 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFRSF8P28908 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFRSF8P28908 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFRSF8P28908 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFRSF8P28908 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFRSF8P28908 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFRSF8P28908 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFRSF8P28908 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFRSF8P28908 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFRSF8P28908 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFRSF8P28908 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFRSF8P28908 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFRSF8P28908 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFRSF8P28908 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFRSF8P28908 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFRSF8P28908 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFRSF8P28908 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFRSF8P28908 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFRSF8P28908 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFRSF8P28908 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFRSF8P28908 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFRSF8P28908 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFRSF8P28908 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFRSF8P28908 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFRSF8P28908 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFRSF8P28908 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFRSF8P28908 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFRSF8P28908 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFRSF8P28908 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFRSF8P28908 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFRSF8P28908 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFRSF8P28908 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFRSF8P28908 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFRSF8P28908 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms