Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
HMGB2P26583 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
HMGB2P26583 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
HMGB2P26583 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
HMGB2P26583 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
HMGB2P26583 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
HMGB2P26583 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC30.35■■■□□ 2.45
HMGB2P26583 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
HMGB2P26583 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
HMGB2P26583 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
HMGB2P26583 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
HMGB2P26583 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.34■■■□□ 2.45
HMGB2P26583 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
HMGB2P26583 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
HMGB2P26583 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
HMGB2P26583 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
HMGB2P26583 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
HMGB2P26583 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
HMGB2P26583 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
HMGB2P26583 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC30.33■■■□□ 2.45
HMGB2P26583 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
HMGB2P26583 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
HMGB2P26583 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
HMGB2P26583 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
HMGB2P26583 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
HMGB2P26583 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
HMGB2P26583 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
HMGB2P26583 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
HMGB2P26583 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
HMGB2P26583 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
HMGB2P26583 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
HMGB2P26583 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
HMGB2P26583 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
HMGB2P26583 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
HMGB2P26583 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
HMGB2P26583 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
HMGB2P26583 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
HMGB2P26583 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
HMGB2P26583 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
HMGB2P26583 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
HMGB2P26583 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
HMGB2P26583 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
HMGB2P26583 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
HMGB2P26583 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
HMGB2P26583 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
HMGB2P26583 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
HMGB2P26583 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
HMGB2P26583 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
HMGB2P26583 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
HMGB2P26583 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
HMGB2P26583 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
HMGB2P26583 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
HMGB2P26583 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
HMGB2P26583 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
HMGB2P26583 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
HMGB2P26583 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
HMGB2P26583 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
HMGB2P26583 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
HMGB2P26583 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC30.26■■■□□ 2.43
HMGB2P26583 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
HMGB2P26583 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
HMGB2P26583 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
HMGB2P26583 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
HMGB2P26583 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
HMGB2P26583 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
HMGB2P26583 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
HMGB2P26583 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
HMGB2P26583 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
HMGB2P26583 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
HMGB2P26583 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
HMGB2P26583 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
HMGB2P26583 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
HMGB2P26583 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
HMGB2P26583 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
HMGB2P26583 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
HMGB2P26583 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
HMGB2P26583 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
HMGB2P26583 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
HMGB2P26583 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
HMGB2P26583 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
HMGB2P26583 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
HMGB2P26583 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
HMGB2P26583 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
HMGB2P26583 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
HMGB2P26583 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
HMGB2P26583 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
HMGB2P26583 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
HMGB2P26583 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
HMGB2P26583 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
HMGB2P26583 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
HMGB2P26583 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
HMGB2P26583 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
HMGB2P26583 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
HMGB2P26583 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
HMGB2P26583 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
HMGB2P26583 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
HMGB2P26583 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
HMGB2P26583 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
HMGB2P26583 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
HMGB2P26583 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms