Protein–RNA interactions for Protein: P26440

IVD, Isovaleryl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IVDP26440 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IVDP26440 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IVDP26440 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IVDP26440 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
IVDP26440 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IVDP26440 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IVDP26440 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IVDP26440 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IVDP26440 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IVDP26440 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IVDP26440 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IVDP26440 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
IVDP26440 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IVDP26440 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IVDP26440 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
IVDP26440 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IVDP26440 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IVDP26440 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IVDP26440 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
IVDP26440 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IVDP26440 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IVDP26440 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IVDP26440 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IVDP26440 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IVDP26440 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IVDP26440 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IVDP26440 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IVDP26440 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IVDP26440 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IVDP26440 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IVDP26440 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IVDP26440 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IVDP26440 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IVDP26440 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IVDP26440 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IVDP26440 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IVDP26440 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IVDP26440 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IVDP26440 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IVDP26440 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IVDP26440 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IVDP26440 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IVDP26440 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IVDP26440 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IVDP26440 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IVDP26440 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IVDP26440 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IVDP26440 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
IVDP26440 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IVDP26440 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IVDP26440 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IVDP26440 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IVDP26440 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IVDP26440 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IVDP26440 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IVDP26440 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IVDP26440 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IVDP26440 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IVDP26440 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IVDP26440 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IVDP26440 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IVDP26440 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IVDP26440 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IVDP26440 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IVDP26440 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IVDP26440 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IVDP26440 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IVDP26440 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IVDP26440 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IVDP26440 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IVDP26440 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IVDP26440 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IVDP26440 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IVDP26440 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IVDP26440 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IVDP26440 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IVDP26440 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IVDP26440 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IVDP26440 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IVDP26440 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IVDP26440 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IVDP26440 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IVDP26440 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IVDP26440 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IVDP26440 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IVDP26440 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IVDP26440 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IVDP26440 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IVDP26440 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IVDP26440 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IVDP26440 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IVDP26440 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
IVDP26440 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
IVDP26440 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
IVDP26440 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IVDP26440 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
IVDP26440 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IVDP26440 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IVDP26440 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IVDP26440 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms