Protein–RNA interactions for Protein: P25490

YY1, Transcriptional repressor protein YY1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YY1P25490 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
YY1P25490 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
YY1P25490 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
YY1P25490 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
YY1P25490 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
YY1P25490 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
YY1P25490 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
YY1P25490 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
YY1P25490 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
YY1P25490 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
YY1P25490 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
YY1P25490 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
YY1P25490 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
YY1P25490 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
YY1P25490 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
YY1P25490 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
YY1P25490 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
YY1P25490 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
YY1P25490 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
YY1P25490 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
YY1P25490 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
YY1P25490 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
YY1P25490 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
YY1P25490 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
YY1P25490 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
YY1P25490 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
YY1P25490 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
YY1P25490 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
YY1P25490 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
YY1P25490 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
YY1P25490 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
YY1P25490 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
YY1P25490 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
YY1P25490 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
YY1P25490 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
YY1P25490 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
YY1P25490 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
YY1P25490 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
YY1P25490 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
YY1P25490 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
YY1P25490 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
YY1P25490 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
YY1P25490 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
YY1P25490 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
YY1P25490 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
YY1P25490 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
YY1P25490 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
YY1P25490 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
YY1P25490 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
YY1P25490 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
YY1P25490 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
YY1P25490 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
YY1P25490 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
YY1P25490 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
YY1P25490 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
YY1P25490 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
YY1P25490 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
YY1P25490 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
YY1P25490 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
YY1P25490 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
YY1P25490 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
YY1P25490 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
YY1P25490 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
YY1P25490 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
YY1P25490 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
YY1P25490 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
YY1P25490 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
YY1P25490 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
YY1P25490 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
YY1P25490 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
YY1P25490 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
YY1P25490 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
YY1P25490 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
YY1P25490 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
YY1P25490 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
YY1P25490 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
YY1P25490 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
YY1P25490 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
YY1P25490 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
YY1P25490 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
YY1P25490 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
YY1P25490 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
YY1P25490 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
YY1P25490 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
YY1P25490 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
YY1P25490 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
YY1P25490 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
YY1P25490 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
YY1P25490 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
YY1P25490 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
YY1P25490 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
YY1P25490 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
YY1P25490 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
YY1P25490 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
YY1P25490 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
YY1P25490 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
YY1P25490 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
YY1P25490 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
YY1P25490 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
YY1P25490 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms