Protein–RNA interactions for Protein: P22460

KCNA5, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 5, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA5P22460 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNA5P22460 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNA5P22460 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNA5P22460 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNA5P22460 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNA5P22460 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNA5P22460 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNA5P22460 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
KCNA5P22460 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNA5P22460 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNA5P22460 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNA5P22460 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNA5P22460 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNA5P22460 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNA5P22460 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNA5P22460 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNA5P22460 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNA5P22460 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNA5P22460 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNA5P22460 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNA5P22460 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNA5P22460 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNA5P22460 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNA5P22460 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNA5P22460 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNA5P22460 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNA5P22460 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNA5P22460 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNA5P22460 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNA5P22460 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNA5P22460 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNA5P22460 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNA5P22460 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNA5P22460 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNA5P22460 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNA5P22460 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNA5P22460 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNA5P22460 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNA5P22460 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNA5P22460 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNA5P22460 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNA5P22460 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNA5P22460 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNA5P22460 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNA5P22460 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNA5P22460 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNA5P22460 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNA5P22460 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNA5P22460 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNA5P22460 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNA5P22460 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNA5P22460 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNA5P22460 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KCNA5P22460 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KCNA5P22460 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KCNA5P22460 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
KCNA5P22460 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KCNA5P22460 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KCNA5P22460 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNA5P22460 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNA5P22460 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNA5P22460 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNA5P22460 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNA5P22460 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNA5P22460 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNA5P22460 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNA5P22460 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNA5P22460 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNA5P22460 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNA5P22460 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNA5P22460 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNA5P22460 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNA5P22460 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNA5P22460 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNA5P22460 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNA5P22460 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNA5P22460 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNA5P22460 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNA5P22460 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNA5P22460 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNA5P22460 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNA5P22460 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNA5P22460 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNA5P22460 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNA5P22460 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNA5P22460 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNA5P22460 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNA5P22460 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNA5P22460 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNA5P22460 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNA5P22460 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNA5P22460 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNA5P22460 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNA5P22460 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNA5P22460 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNA5P22460 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNA5P22460 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNA5P22460 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
KCNA5P22460 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
KCNA5P22460 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms