Protein–RNA interactions for Protein: P22061

PCMT1, Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMT1P22061 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCMT1P22061 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCMT1P22061 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCMT1P22061 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCMT1P22061 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCMT1P22061 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCMT1P22061 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCMT1P22061 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCMT1P22061 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCMT1P22061 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCMT1P22061 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCMT1P22061 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCMT1P22061 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCMT1P22061 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCMT1P22061 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCMT1P22061 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCMT1P22061 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCMT1P22061 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCMT1P22061 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PCMT1P22061 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCMT1P22061 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCMT1P22061 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCMT1P22061 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PCMT1P22061 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCMT1P22061 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCMT1P22061 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCMT1P22061 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCMT1P22061 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCMT1P22061 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCMT1P22061 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCMT1P22061 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCMT1P22061 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCMT1P22061 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCMT1P22061 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PCMT1P22061 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCMT1P22061 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCMT1P22061 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCMT1P22061 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCMT1P22061 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCMT1P22061 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCMT1P22061 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCMT1P22061 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCMT1P22061 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCMT1P22061 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCMT1P22061 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCMT1P22061 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCMT1P22061 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCMT1P22061 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCMT1P22061 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCMT1P22061 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCMT1P22061 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCMT1P22061 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCMT1P22061 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCMT1P22061 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCMT1P22061 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCMT1P22061 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCMT1P22061 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCMT1P22061 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCMT1P22061 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCMT1P22061 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCMT1P22061 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCMT1P22061 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCMT1P22061 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCMT1P22061 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCMT1P22061 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCMT1P22061 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCMT1P22061 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCMT1P22061 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCMT1P22061 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCMT1P22061 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCMT1P22061 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCMT1P22061 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCMT1P22061 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCMT1P22061 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCMT1P22061 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCMT1P22061 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCMT1P22061 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCMT1P22061 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCMT1P22061 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCMT1P22061 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCMT1P22061 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCMT1P22061 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCMT1P22061 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCMT1P22061 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCMT1P22061 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCMT1P22061 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCMT1P22061 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCMT1P22061 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCMT1P22061 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCMT1P22061 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCMT1P22061 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCMT1P22061 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCMT1P22061 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCMT1P22061 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCMT1P22061 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCMT1P22061 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCMT1P22061 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCMT1P22061 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCMT1P22061 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCMT1P22061 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.5 ms