Protein–RNA interactions for Protein: P21246

PTN, Pleiotrophin, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTNP21246 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTNP21246 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTNP21246 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTNP21246 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTNP21246 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTNP21246 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTNP21246 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTNP21246 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTNP21246 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTNP21246 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTNP21246 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTNP21246 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTNP21246 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTNP21246 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTNP21246 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTNP21246 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTNP21246 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTNP21246 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTNP21246 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTNP21246 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTNP21246 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTNP21246 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTNP21246 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTNP21246 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PTNP21246 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTNP21246 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTNP21246 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTNP21246 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTNP21246 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTNP21246 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTNP21246 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTNP21246 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTNP21246 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTNP21246 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTNP21246 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTNP21246 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTNP21246 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTNP21246 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTNP21246 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTNP21246 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTNP21246 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTNP21246 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTNP21246 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTNP21246 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PTNP21246 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTNP21246 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTNP21246 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTNP21246 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTNP21246 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTNP21246 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTNP21246 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTNP21246 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTNP21246 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTNP21246 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTNP21246 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PTNP21246 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTNP21246 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTNP21246 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PTNP21246 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTNP21246 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTNP21246 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTNP21246 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTNP21246 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTNP21246 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTNP21246 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTNP21246 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTNP21246 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTNP21246 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PTNP21246 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTNP21246 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTNP21246 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTNP21246 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTNP21246 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTNP21246 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTNP21246 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTNP21246 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTNP21246 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTNP21246 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTNP21246 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTNP21246 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTNP21246 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTNP21246 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTNP21246 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTNP21246 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTNP21246 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PTNP21246 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PTNP21246 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTNP21246 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PTNP21246 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTNP21246 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTNP21246 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTNP21246 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTNP21246 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTNP21246 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTNP21246 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTNP21246 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTNP21246 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTNP21246 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTNP21246 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTNP21246 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms