Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CXCL2P19875 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CXCL2P19875 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CXCL2P19875 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CXCL2P19875 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CXCL2P19875 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CXCL2P19875 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CXCL2P19875 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CXCL2P19875 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CXCL2P19875 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CXCL2P19875 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CXCL2P19875 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CXCL2P19875 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CXCL2P19875 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CXCL2P19875 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CXCL2P19875 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CXCL2P19875 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CXCL2P19875 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CXCL2P19875 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CXCL2P19875 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CXCL2P19875 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CXCL2P19875 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CXCL2P19875 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CXCL2P19875 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CXCL2P19875 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CXCL2P19875 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CXCL2P19875 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CXCL2P19875 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CXCL2P19875 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CXCL2P19875 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CXCL2P19875 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CXCL2P19875 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CXCL2P19875 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CXCL2P19875 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CXCL2P19875 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CXCL2P19875 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CXCL2P19875 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CXCL2P19875 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CXCL2P19875 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CXCL2P19875 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CXCL2P19875 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CXCL2P19875 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CXCL2P19875 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CXCL2P19875 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CXCL2P19875 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CXCL2P19875 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CXCL2P19875 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CXCL2P19875 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CXCL2P19875 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CXCL2P19875 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CXCL2P19875 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CXCL2P19875 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CXCL2P19875 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CXCL2P19875 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CXCL2P19875 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CXCL2P19875 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CXCL2P19875 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CXCL2P19875 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CXCL2P19875 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CXCL2P19875 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CXCL2P19875 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CXCL2P19875 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CXCL2P19875 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CXCL2P19875 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CXCL2P19875 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CXCL2P19875 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CXCL2P19875 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CXCL2P19875 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CXCL2P19875 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CXCL2P19875 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CXCL2P19875 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CXCL2P19875 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CXCL2P19875 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CXCL2P19875 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CXCL2P19875 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CXCL2P19875 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CXCL2P19875 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CXCL2P19875 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CXCL2P19875 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CXCL2P19875 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CXCL2P19875 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CXCL2P19875 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CXCL2P19875 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CXCL2P19875 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CXCL2P19875 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CXCL2P19875 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CXCL2P19875 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CXCL2P19875 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CXCL2P19875 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CXCL2P19875 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CXCL2P19875 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CXCL2P19875 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CXCL2P19875 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CXCL2P19875 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CXCL2P19875 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CXCL2P19875 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CXCL2P19875 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CXCL2P19875 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CXCL2P19875 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CXCL2P19875 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms