Protein–RNA interactions for Protein: P18887

XRCC1, DNA repair protein XRCC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC1P18887 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
XRCC1P18887 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
XRCC1P18887 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
XRCC1P18887 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
XRCC1P18887 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
XRCC1P18887 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XRCC1P18887 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XRCC1P18887 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
XRCC1P18887 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
XRCC1P18887 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
XRCC1P18887 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
XRCC1P18887 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
XRCC1P18887 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XRCC1P18887 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XRCC1P18887 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
XRCC1P18887 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XRCC1P18887 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XRCC1P18887 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
XRCC1P18887 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XRCC1P18887 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XRCC1P18887 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XRCC1P18887 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XRCC1P18887 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XRCC1P18887 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XRCC1P18887 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XRCC1P18887 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XRCC1P18887 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XRCC1P18887 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XRCC1P18887 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XRCC1P18887 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XRCC1P18887 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XRCC1P18887 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XRCC1P18887 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XRCC1P18887 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XRCC1P18887 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XRCC1P18887 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XRCC1P18887 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XRCC1P18887 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
XRCC1P18887 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
XRCC1P18887 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
XRCC1P18887 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
XRCC1P18887 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
XRCC1P18887 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
XRCC1P18887 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
XRCC1P18887 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
XRCC1P18887 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
XRCC1P18887 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
XRCC1P18887 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
XRCC1P18887 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XRCC1P18887 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XRCC1P18887 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
XRCC1P18887 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XRCC1P18887 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XRCC1P18887 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
XRCC1P18887 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
XRCC1P18887 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
XRCC1P18887 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
XRCC1P18887 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
XRCC1P18887 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
XRCC1P18887 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
XRCC1P18887 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
XRCC1P18887 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
XRCC1P18887 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
XRCC1P18887 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
XRCC1P18887 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
XRCC1P18887 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
XRCC1P18887 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
XRCC1P18887 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
XRCC1P18887 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
XRCC1P18887 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
XRCC1P18887 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
XRCC1P18887 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
XRCC1P18887 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
XRCC1P18887 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
XRCC1P18887 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
XRCC1P18887 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
XRCC1P18887 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
XRCC1P18887 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
XRCC1P18887 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
XRCC1P18887 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
XRCC1P18887 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
XRCC1P18887 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
XRCC1P18887 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
XRCC1P18887 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
XRCC1P18887 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
XRCC1P18887 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
XRCC1P18887 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
XRCC1P18887 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
XRCC1P18887 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
XRCC1P18887 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
XRCC1P18887 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
XRCC1P18887 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
XRCC1P18887 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
XRCC1P18887 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
XRCC1P18887 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
XRCC1P18887 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
XRCC1P18887 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
XRCC1P18887 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
XRCC1P18887 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
XRCC1P18887 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms