Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ATF3P18847 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ATF3P18847 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ATF3P18847 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
ATF3P18847 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
ATF3P18847 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
ATF3P18847 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
ATF3P18847 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
ATF3P18847 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
ATF3P18847 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
ATF3P18847 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
ATF3P18847 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
ATF3P18847 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
ATF3P18847 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
ATF3P18847 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
ATF3P18847 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
ATF3P18847 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
ATF3P18847 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
ATF3P18847 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ATF3P18847 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ATF3P18847 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
ATF3P18847 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
ATF3P18847 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
ATF3P18847 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
ATF3P18847 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
ATF3P18847 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
ATF3P18847 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
ATF3P18847 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
ATF3P18847 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
ATF3P18847 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
ATF3P18847 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ATF3P18847 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ATF3P18847 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
ATF3P18847 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
ATF3P18847 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
ATF3P18847 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
ATF3P18847 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ATF3P18847 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ATF3P18847 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
ATF3P18847 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ATF3P18847 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
ATF3P18847 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
ATF3P18847 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
ATF3P18847 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
ATF3P18847 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
ATF3P18847 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
ATF3P18847 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
ATF3P18847 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
ATF3P18847 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
ATF3P18847 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
ATF3P18847 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
ATF3P18847 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
ATF3P18847 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
ATF3P18847 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
ATF3P18847 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
ATF3P18847 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
ATF3P18847 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
ATF3P18847 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
ATF3P18847 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
ATF3P18847 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
ATF3P18847 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
ATF3P18847 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
ATF3P18847 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ATF3P18847 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ATF3P18847 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC33■■■□□ 2.87
ATF3P18847 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC33■■■□□ 2.87
ATF3P18847 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
ATF3P18847 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
ATF3P18847 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
ATF3P18847 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
ATF3P18847 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
ATF3P18847 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
ATF3P18847 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
ATF3P18847 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
ATF3P18847 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
ATF3P18847 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
ATF3P18847 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
ATF3P18847 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
ATF3P18847 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
ATF3P18847 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
ATF3P18847 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
ATF3P18847 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
ATF3P18847 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
ATF3P18847 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
ATF3P18847 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
ATF3P18847 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
ATF3P18847 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
ATF3P18847 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
ATF3P18847 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ATF3P18847 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
ATF3P18847 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ATF3P18847 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
ATF3P18847 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ATF3P18847 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
ATF3P18847 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
ATF3P18847 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
ATF3P18847 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ATF3P18847 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
ATF3P18847 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
ATF3P18847 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.6 ms