Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB9P17482 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB9P17482 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB9P17482 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB9P17482 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB9P17482 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB9P17482 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB9P17482 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB9P17482 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXB9P17482 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXB9P17482 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXB9P17482 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXB9P17482 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXB9P17482 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
HOXB9P17482 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB9P17482 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB9P17482 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB9P17482 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB9P17482 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB9P17482 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB9P17482 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB9P17482 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB9P17482 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB9P17482 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB9P17482 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB9P17482 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB9P17482 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB9P17482 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB9P17482 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXB9P17482 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXB9P17482 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXB9P17482 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXB9P17482 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXB9P17482 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXB9P17482 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXB9P17482 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXB9P17482 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXB9P17482 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXB9P17482 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXB9P17482 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXB9P17482 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXB9P17482 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXB9P17482 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXB9P17482 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXB9P17482 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXB9P17482 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXB9P17482 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXB9P17482 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXB9P17482 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXB9P17482 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXB9P17482 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXB9P17482 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXB9P17482 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXB9P17482 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXB9P17482 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXB9P17482 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXB9P17482 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
HOXB9P17482 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB9P17482 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB9P17482 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB9P17482 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB9P17482 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB9P17482 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB9P17482 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXB9P17482 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXB9P17482 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXB9P17482 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXB9P17482 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXB9P17482 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXB9P17482 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXB9P17482 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB9P17482 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB9P17482 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB9P17482 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB9P17482 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB9P17482 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB9P17482 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB9P17482 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB9P17482 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB9P17482 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB9P17482 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB9P17482 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB9P17482 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB9P17482 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXB9P17482 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXB9P17482 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXB9P17482 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXB9P17482 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXB9P17482 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXB9P17482 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXB9P17482 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXB9P17482 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXB9P17482 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXB9P17482 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXB9P17482 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB9P17482 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB9P17482 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB9P17482 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB9P17482 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB9P17482 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms