Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJA1P17302 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJA1P17302 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJA1P17302 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJA1P17302 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJA1P17302 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJA1P17302 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJA1P17302 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJA1P17302 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJA1P17302 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJA1P17302 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GJA1P17302 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GJA1P17302 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GJA1P17302 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GJA1P17302 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJA1P17302 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJA1P17302 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJA1P17302 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GJA1P17302 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJA1P17302 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJA1P17302 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJA1P17302 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJA1P17302 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJA1P17302 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJA1P17302 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJA1P17302 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJA1P17302 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJA1P17302 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJA1P17302 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJA1P17302 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJA1P17302 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJA1P17302 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJA1P17302 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GJA1P17302 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJA1P17302 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJA1P17302 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJA1P17302 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GJA1P17302 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJA1P17302 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJA1P17302 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJA1P17302 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJA1P17302 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJA1P17302 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJA1P17302 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJA1P17302 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJA1P17302 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJA1P17302 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJA1P17302 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJA1P17302 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJA1P17302 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJA1P17302 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJA1P17302 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJA1P17302 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJA1P17302 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJA1P17302 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJA1P17302 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GJA1P17302 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GJA1P17302 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GJA1P17302 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GJA1P17302 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GJA1P17302 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GJA1P17302 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GJA1P17302 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJA1P17302 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJA1P17302 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJA1P17302 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJA1P17302 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJA1P17302 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJA1P17302 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJA1P17302 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJA1P17302 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJA1P17302 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJA1P17302 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJA1P17302 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJA1P17302 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJA1P17302 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJA1P17302 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJA1P17302 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJA1P17302 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJA1P17302 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GJA1P17302 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJA1P17302 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJA1P17302 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJA1P17302 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJA1P17302 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJA1P17302 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJA1P17302 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GJA1P17302 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJA1P17302 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJA1P17302 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GJA1P17302 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJA1P17302 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJA1P17302 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJA1P17302 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJA1P17302 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJA1P17302 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJA1P17302 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJA1P17302 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJA1P17302 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJA1P17302 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms