Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
EPCAMP16422 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPCAMP16422 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPCAMP16422 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPCAMP16422 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPCAMP16422 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPCAMP16422 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPCAMP16422 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPCAMP16422 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPCAMP16422 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPCAMP16422 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPCAMP16422 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPCAMP16422 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EPCAMP16422 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EPCAMP16422 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EPCAMP16422 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
EPCAMP16422 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EPCAMP16422 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
EPCAMP16422 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EPCAMP16422 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EPCAMP16422 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EPCAMP16422 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EPCAMP16422 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPCAMP16422 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPCAMP16422 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
EPCAMP16422 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPCAMP16422 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPCAMP16422 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPCAMP16422 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
EPCAMP16422 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
EPCAMP16422 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPCAMP16422 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPCAMP16422 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EPCAMP16422 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EPCAMP16422 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EPCAMP16422 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EPCAMP16422 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EPCAMP16422 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EPCAMP16422 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EPCAMP16422 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EPCAMP16422 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EPCAMP16422 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EPCAMP16422 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EPCAMP16422 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EPCAMP16422 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EPCAMP16422 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EPCAMP16422 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EPCAMP16422 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EPCAMP16422 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EPCAMP16422 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EPCAMP16422 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
EPCAMP16422 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EPCAMP16422 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EPCAMP16422 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EPCAMP16422 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
EPCAMP16422 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EPCAMP16422 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EPCAMP16422 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EPCAMP16422 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EPCAMP16422 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EPCAMP16422 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EPCAMP16422 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EPCAMP16422 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EPCAMP16422 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EPCAMP16422 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EPCAMP16422 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EPCAMP16422 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EPCAMP16422 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EPCAMP16422 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
EPCAMP16422 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
EPCAMP16422 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EPCAMP16422 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EPCAMP16422 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EPCAMP16422 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EPCAMP16422 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EPCAMP16422 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EPCAMP16422 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EPCAMP16422 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EPCAMP16422 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EPCAMP16422 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EPCAMP16422 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EPCAMP16422 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EPCAMP16422 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EPCAMP16422 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
EPCAMP16422 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EPCAMP16422 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EPCAMP16422 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EPCAMP16422 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EPCAMP16422 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EPCAMP16422 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EPCAMP16422 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EPCAMP16422 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EPCAMP16422 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
EPCAMP16422 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EPCAMP16422 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EPCAMP16422 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EPCAMP16422 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EPCAMP16422 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EPCAMP16422 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EPCAMP16422 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms